Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smc3Q9CW03 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smc3Q9CW03 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smc3Q9CW03 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smc3Q9CW03 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smc3Q9CW03 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smc3Q9CW03 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smc3Q9CW03 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smc3Q9CW03 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smc3Q9CW03 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smc3Q9CW03 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smc3Q9CW03 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smc3Q9CW03 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Smc3Q9CW03 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Smc3Q9CW03 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Smc3Q9CW03 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Smc3Q9CW03 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smc3Q9CW03 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smc3Q9CW03 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smc3Q9CW03 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smc3Q9CW03 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smc3Q9CW03 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smc3Q9CW03 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smc3Q9CW03 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smc3Q9CW03 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Smc3Q9CW03 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smc3Q9CW03 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smc3Q9CW03 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smc3Q9CW03 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smc3Q9CW03 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Smc3Q9CW03 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Smc3Q9CW03 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smc3Q9CW03 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Smc3Q9CW03 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smc3Q9CW03 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smc3Q9CW03 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smc3Q9CW03 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smc3Q9CW03 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smc3Q9CW03 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smc3Q9CW03 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smc3Q9CW03 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smc3Q9CW03 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smc3Q9CW03 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smc3Q9CW03 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Smc3Q9CW03 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smc3Q9CW03 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smc3Q9CW03 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smc3Q9CW03 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smc3Q9CW03 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smc3Q9CW03 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smc3Q9CW03 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smc3Q9CW03 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smc3Q9CW03 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Smc3Q9CW03 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smc3Q9CW03 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smc3Q9CW03 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smc3Q9CW03 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smc3Q9CW03 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smc3Q9CW03 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smc3Q9CW03 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smc3Q9CW03 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smc3Q9CW03 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smc3Q9CW03 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smc3Q9CW03 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smc3Q9CW03 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smc3Q9CW03 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smc3Q9CW03 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smc3Q9CW03 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smc3Q9CW03 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smc3Q9CW03 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smc3Q9CW03 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Smc3Q9CW03 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Smc3Q9CW03 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Smc3Q9CW03 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smc3Q9CW03 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smc3Q9CW03 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Smc3Q9CW03 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Smc3Q9CW03 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smc3Q9CW03 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Smc3Q9CW03 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smc3Q9CW03 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smc3Q9CW03 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smc3Q9CW03 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smc3Q9CW03 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Smc3Q9CW03 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Smc3Q9CW03 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smc3Q9CW03 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smc3Q9CW03 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smc3Q9CW03 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smc3Q9CW03 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smc3Q9CW03 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smc3Q9CW03 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smc3Q9CW03 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smc3Q9CW03 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smc3Q9CW03 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Smc3Q9CW03 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Smc3Q9CW03 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smc3Q9CW03 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smc3Q9CW03 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smc3Q9CW03 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms