Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Dis3Q9CSH3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dis3Q9CSH3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dis3Q9CSH3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dis3Q9CSH3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dis3Q9CSH3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dis3Q9CSH3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Dis3Q9CSH3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dis3Q9CSH3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Dis3Q9CSH3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Dis3Q9CSH3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Dis3Q9CSH3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Dis3Q9CSH3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Dis3Q9CSH3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Dis3Q9CSH3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Dis3Q9CSH3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Dis3Q9CSH3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Dis3Q9CSH3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dis3Q9CSH3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dis3Q9CSH3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dis3Q9CSH3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Dis3Q9CSH3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dis3Q9CSH3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Dis3Q9CSH3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Dis3Q9CSH3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Dis3Q9CSH3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Dis3Q9CSH3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Dis3Q9CSH3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Dis3Q9CSH3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dis3Q9CSH3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Dis3Q9CSH3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dis3Q9CSH3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dis3Q9CSH3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dis3Q9CSH3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dis3Q9CSH3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dis3Q9CSH3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dis3Q9CSH3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dis3Q9CSH3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dis3Q9CSH3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dis3Q9CSH3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dis3Q9CSH3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dis3Q9CSH3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dis3Q9CSH3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dis3Q9CSH3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dis3Q9CSH3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dis3Q9CSH3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dis3Q9CSH3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dis3Q9CSH3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dis3Q9CSH3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dis3Q9CSH3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dis3Q9CSH3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Dis3Q9CSH3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Dis3Q9CSH3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dis3Q9CSH3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dis3Q9CSH3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dis3Q9CSH3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dis3Q9CSH3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dis3Q9CSH3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dis3Q9CSH3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dis3Q9CSH3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dis3Q9CSH3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dis3Q9CSH3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dis3Q9CSH3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dis3Q9CSH3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dis3Q9CSH3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dis3Q9CSH3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Dis3Q9CSH3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Dis3Q9CSH3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dis3Q9CSH3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dis3Q9CSH3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Dis3Q9CSH3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dis3Q9CSH3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dis3Q9CSH3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dis3Q9CSH3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dis3Q9CSH3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dis3Q9CSH3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dis3Q9CSH3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dis3Q9CSH3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dis3Q9CSH3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dis3Q9CSH3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dis3Q9CSH3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dis3Q9CSH3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dis3Q9CSH3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dis3Q9CSH3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dis3Q9CSH3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dis3Q9CSH3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dis3Q9CSH3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dis3Q9CSH3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Dis3Q9CSH3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dis3Q9CSH3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dis3Q9CSH3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dis3Q9CSH3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dis3Q9CSH3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dis3Q9CSH3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dis3Q9CSH3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dis3Q9CSH3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Dis3Q9CSH3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dis3Q9CSH3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dis3Q9CSH3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dis3Q9CSH3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms