Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gnpda2Q9CRC9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gnpda2Q9CRC9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gnpda2Q9CRC9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gnpda2Q9CRC9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gnpda2Q9CRC9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gnpda2Q9CRC9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gnpda2Q9CRC9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gnpda2Q9CRC9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gnpda2Q9CRC9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gnpda2Q9CRC9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gnpda2Q9CRC9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gnpda2Q9CRC9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gnpda2Q9CRC9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gnpda2Q9CRC9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gnpda2Q9CRC9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gnpda2Q9CRC9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gnpda2Q9CRC9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gnpda2Q9CRC9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gnpda2Q9CRC9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gnpda2Q9CRC9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gnpda2Q9CRC9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gnpda2Q9CRC9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gnpda2Q9CRC9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gnpda2Q9CRC9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gnpda2Q9CRC9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gnpda2Q9CRC9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gnpda2Q9CRC9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gnpda2Q9CRC9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gnpda2Q9CRC9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gnpda2Q9CRC9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gnpda2Q9CRC9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gnpda2Q9CRC9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gnpda2Q9CRC9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gnpda2Q9CRC9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gnpda2Q9CRC9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gnpda2Q9CRC9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gnpda2Q9CRC9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gnpda2Q9CRC9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gnpda2Q9CRC9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gnpda2Q9CRC9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gnpda2Q9CRC9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gnpda2Q9CRC9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gnpda2Q9CRC9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gnpda2Q9CRC9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gnpda2Q9CRC9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gnpda2Q9CRC9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gnpda2Q9CRC9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gnpda2Q9CRC9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gnpda2Q9CRC9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gnpda2Q9CRC9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gnpda2Q9CRC9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gnpda2Q9CRC9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gnpda2Q9CRC9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gnpda2Q9CRC9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gnpda2Q9CRC9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gnpda2Q9CRC9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gnpda2Q9CRC9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gnpda2Q9CRC9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gnpda2Q9CRC9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gnpda2Q9CRC9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gnpda2Q9CRC9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gnpda2Q9CRC9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gnpda2Q9CRC9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gnpda2Q9CRC9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gnpda2Q9CRC9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gnpda2Q9CRC9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gnpda2Q9CRC9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gnpda2Q9CRC9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gnpda2Q9CRC9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gnpda2Q9CRC9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gnpda2Q9CRC9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gnpda2Q9CRC9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gnpda2Q9CRC9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gnpda2Q9CRC9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gnpda2Q9CRC9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gnpda2Q9CRC9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gnpda2Q9CRC9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gnpda2Q9CRC9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gnpda2Q9CRC9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gnpda2Q9CRC9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gnpda2Q9CRC9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gnpda2Q9CRC9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gnpda2Q9CRC9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gnpda2Q9CRC9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gnpda2Q9CRC9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gnpda2Q9CRC9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gnpda2Q9CRC9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gnpda2Q9CRC9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gnpda2Q9CRC9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gnpda2Q9CRC9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gnpda2Q9CRC9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gnpda2Q9CRC9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gnpda2Q9CRC9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gnpda2Q9CRC9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gnpda2Q9CRC9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gnpda2Q9CRC9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gnpda2Q9CRC9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gnpda2Q9CRC9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gnpda2Q9CRC9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms