Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB9

Chchd3, MICOS complex subunit Mic19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd3Q9CRB9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chchd3Q9CRB9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chchd3Q9CRB9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chchd3Q9CRB9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chchd3Q9CRB9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chchd3Q9CRB9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chchd3Q9CRB9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chchd3Q9CRB9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chchd3Q9CRB9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chchd3Q9CRB9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chchd3Q9CRB9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chchd3Q9CRB9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chchd3Q9CRB9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chchd3Q9CRB9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chchd3Q9CRB9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chchd3Q9CRB9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chchd3Q9CRB9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chchd3Q9CRB9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chchd3Q9CRB9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chchd3Q9CRB9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chchd3Q9CRB9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chchd3Q9CRB9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chchd3Q9CRB9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chchd3Q9CRB9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chchd3Q9CRB9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chchd3Q9CRB9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chchd3Q9CRB9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chchd3Q9CRB9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chchd3Q9CRB9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chchd3Q9CRB9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chchd3Q9CRB9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chchd3Q9CRB9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chchd3Q9CRB9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chchd3Q9CRB9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chchd3Q9CRB9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chchd3Q9CRB9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Chchd3Q9CRB9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chchd3Q9CRB9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chchd3Q9CRB9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chchd3Q9CRB9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chchd3Q9CRB9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chchd3Q9CRB9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chchd3Q9CRB9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chchd3Q9CRB9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chchd3Q9CRB9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chchd3Q9CRB9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chchd3Q9CRB9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chchd3Q9CRB9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chchd3Q9CRB9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chchd3Q9CRB9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chchd3Q9CRB9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chchd3Q9CRB9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chchd3Q9CRB9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chchd3Q9CRB9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chchd3Q9CRB9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chchd3Q9CRB9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chchd3Q9CRB9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chchd3Q9CRB9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chchd3Q9CRB9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chchd3Q9CRB9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chchd3Q9CRB9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Chchd3Q9CRB9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chchd3Q9CRB9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chchd3Q9CRB9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chchd3Q9CRB9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chchd3Q9CRB9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chchd3Q9CRB9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chchd3Q9CRB9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chchd3Q9CRB9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chchd3Q9CRB9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chchd3Q9CRB9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chchd3Q9CRB9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chchd3Q9CRB9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chchd3Q9CRB9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chchd3Q9CRB9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chchd3Q9CRB9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Chchd3Q9CRB9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chchd3Q9CRB9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chchd3Q9CRB9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chchd3Q9CRB9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chchd3Q9CRB9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chchd3Q9CRB9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chchd3Q9CRB9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chchd3Q9CRB9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chchd3Q9CRB9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chchd3Q9CRB9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chchd3Q9CRB9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chchd3Q9CRB9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chchd3Q9CRB9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chchd3Q9CRB9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chchd3Q9CRB9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chchd3Q9CRB9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chchd3Q9CRB9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chchd3Q9CRB9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chchd3Q9CRB9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chchd3Q9CRB9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chchd3Q9CRB9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chchd3Q9CRB9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chchd3Q9CRB9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chchd3Q9CRB9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms