Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9CR55 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9CR55 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9CR55 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9CR55 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9CR55 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9CR55 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9CR55 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9CR55 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9CR55 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9CR55 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9CR55 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9CR55 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9CR55 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9CR55 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9CR55 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9CR55 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9CR55 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9CR55 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q9CR55 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9CR55 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9CR55 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9CR55 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9CR55 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9CR55 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9CR55 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9CR55 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9CR55 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9CR55 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9CR55 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9CR55 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9CR55 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9CR55 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9CR55 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9CR55 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9CR55 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9CR55 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9CR55 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9CR55 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9CR55 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9CR55 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9CR55 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9CR55 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9CR55 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9CR55 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9CR55 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9CR55 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9CR55 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9CR55 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9CR55 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9CR55 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9CR55 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9CR55 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9CR55 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9CR55 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9CR55 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9CR55 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9CR55 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9CR55 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9CR55 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9CR55 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9CR55 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9CR55 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9CR55 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9CR55 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9CR55 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9CR55 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9CR55 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9CR55 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9CR55 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9CR55 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9CR55 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9CR55 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9CR55 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9CR55 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9CR55 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9CR55 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9CR55 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q9CR55 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9CR55 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9CR55 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9CR55 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9CR55 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9CR55 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9CR55 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9CR55 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9CR55 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9CR55 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9CR55 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9CR55 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9CR55 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9CR55 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9CR55 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9CR55 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9CR55 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9CR55 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9CR55 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9CR55 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9CR55 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9CR55 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms