Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl28Q9CR40 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl28Q9CR40 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl28Q9CR40 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl28Q9CR40 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl28Q9CR40 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl28Q9CR40 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl28Q9CR40 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl28Q9CR40 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl28Q9CR40 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl28Q9CR40 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl28Q9CR40 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Klhl28Q9CR40 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl28Q9CR40 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhl28Q9CR40 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl28Q9CR40 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl28Q9CR40 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl28Q9CR40 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl28Q9CR40 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl28Q9CR40 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl28Q9CR40 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl28Q9CR40 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl28Q9CR40 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl28Q9CR40 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl28Q9CR40 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl28Q9CR40 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl28Q9CR40 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl28Q9CR40 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl28Q9CR40 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl28Q9CR40 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl28Q9CR40 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl28Q9CR40 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl28Q9CR40 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl28Q9CR40 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl28Q9CR40 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl28Q9CR40 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl28Q9CR40 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl28Q9CR40 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl28Q9CR40 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl28Q9CR40 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl28Q9CR40 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl28Q9CR40 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl28Q9CR40 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl28Q9CR40 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhl28Q9CR40 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl28Q9CR40 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl28Q9CR40 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl28Q9CR40 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl28Q9CR40 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl28Q9CR40 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl28Q9CR40 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl28Q9CR40 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl28Q9CR40 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl28Q9CR40 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl28Q9CR40 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl28Q9CR40 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl28Q9CR40 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl28Q9CR40 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl28Q9CR40 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl28Q9CR40 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl28Q9CR40 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl28Q9CR40 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl28Q9CR40 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhl28Q9CR40 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhl28Q9CR40 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhl28Q9CR40 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Klhl28Q9CR40 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl28Q9CR40 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl28Q9CR40 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl28Q9CR40 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl28Q9CR40 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl28Q9CR40 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl28Q9CR40 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl28Q9CR40 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl28Q9CR40 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl28Q9CR40 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl28Q9CR40 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl28Q9CR40 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl28Q9CR40 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl28Q9CR40 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl28Q9CR40 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl28Q9CR40 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl28Q9CR40 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl28Q9CR40 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl28Q9CR40 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl28Q9CR40 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl28Q9CR40 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl28Q9CR40 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl28Q9CR40 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl28Q9CR40 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl28Q9CR40 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl28Q9CR40 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl28Q9CR40 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl28Q9CR40 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl28Q9CR40 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl28Q9CR40 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl28Q9CR40 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl28Q9CR40 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl28Q9CR40 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl28Q9CR40 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms