Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR25

Dph2, 2-(3-amino-3-carboxypropyl)histidine synthase subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dph2Q9CR25 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dph2Q9CR25 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dph2Q9CR25 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dph2Q9CR25 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dph2Q9CR25 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dph2Q9CR25 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dph2Q9CR25 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dph2Q9CR25 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dph2Q9CR25 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dph2Q9CR25 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dph2Q9CR25 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dph2Q9CR25 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dph2Q9CR25 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dph2Q9CR25 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dph2Q9CR25 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dph2Q9CR25 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dph2Q9CR25 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dph2Q9CR25 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dph2Q9CR25 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dph2Q9CR25 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dph2Q9CR25 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dph2Q9CR25 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dph2Q9CR25 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dph2Q9CR25 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dph2Q9CR25 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dph2Q9CR25 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Dph2Q9CR25 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dph2Q9CR25 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dph2Q9CR25 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dph2Q9CR25 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dph2Q9CR25 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dph2Q9CR25 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dph2Q9CR25 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dph2Q9CR25 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dph2Q9CR25 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dph2Q9CR25 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dph2Q9CR25 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dph2Q9CR25 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dph2Q9CR25 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dph2Q9CR25 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dph2Q9CR25 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dph2Q9CR25 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dph2Q9CR25 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dph2Q9CR25 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dph2Q9CR25 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dph2Q9CR25 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dph2Q9CR25 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dph2Q9CR25 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dph2Q9CR25 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dph2Q9CR25 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dph2Q9CR25 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dph2Q9CR25 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dph2Q9CR25 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dph2Q9CR25 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dph2Q9CR25 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dph2Q9CR25 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dph2Q9CR25 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dph2Q9CR25 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dph2Q9CR25 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Dph2Q9CR25 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dph2Q9CR25 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dph2Q9CR25 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dph2Q9CR25 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dph2Q9CR25 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dph2Q9CR25 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dph2Q9CR25 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dph2Q9CR25 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dph2Q9CR25 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dph2Q9CR25 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dph2Q9CR25 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dph2Q9CR25 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dph2Q9CR25 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dph2Q9CR25 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dph2Q9CR25 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Dph2Q9CR25 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dph2Q9CR25 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dph2Q9CR25 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dph2Q9CR25 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dph2Q9CR25 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dph2Q9CR25 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dph2Q9CR25 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dph2Q9CR25 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dph2Q9CR25 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dph2Q9CR25 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dph2Q9CR25 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dph2Q9CR25 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dph2Q9CR25 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dph2Q9CR25 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dph2Q9CR25 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dph2Q9CR25 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dph2Q9CR25 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dph2Q9CR25 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dph2Q9CR25 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Dph2Q9CR25 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dph2Q9CR25 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dph2Q9CR25 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dph2Q9CR25 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dph2Q9CR25 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dph2Q9CR25 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dph2Q9CR25 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms