Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncbp2Q9CQ49 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncbp2Q9CQ49 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncbp2Q9CQ49 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncbp2Q9CQ49 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncbp2Q9CQ49 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncbp2Q9CQ49 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncbp2Q9CQ49 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncbp2Q9CQ49 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncbp2Q9CQ49 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncbp2Q9CQ49 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncbp2Q9CQ49 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncbp2Q9CQ49 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncbp2Q9CQ49 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncbp2Q9CQ49 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncbp2Q9CQ49 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncbp2Q9CQ49 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncbp2Q9CQ49 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncbp2Q9CQ49 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncbp2Q9CQ49 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncbp2Q9CQ49 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncbp2Q9CQ49 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncbp2Q9CQ49 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncbp2Q9CQ49 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncbp2Q9CQ49 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncbp2Q9CQ49 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncbp2Q9CQ49 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ncbp2Q9CQ49 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncbp2Q9CQ49 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncbp2Q9CQ49 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncbp2Q9CQ49 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncbp2Q9CQ49 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncbp2Q9CQ49 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncbp2Q9CQ49 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncbp2Q9CQ49 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncbp2Q9CQ49 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncbp2Q9CQ49 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncbp2Q9CQ49 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncbp2Q9CQ49 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncbp2Q9CQ49 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncbp2Q9CQ49 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncbp2Q9CQ49 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncbp2Q9CQ49 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncbp2Q9CQ49 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncbp2Q9CQ49 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncbp2Q9CQ49 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncbp2Q9CQ49 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncbp2Q9CQ49 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncbp2Q9CQ49 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncbp2Q9CQ49 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncbp2Q9CQ49 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncbp2Q9CQ49 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncbp2Q9CQ49 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncbp2Q9CQ49 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncbp2Q9CQ49 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncbp2Q9CQ49 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncbp2Q9CQ49 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncbp2Q9CQ49 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncbp2Q9CQ49 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncbp2Q9CQ49 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncbp2Q9CQ49 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncbp2Q9CQ49 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncbp2Q9CQ49 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncbp2Q9CQ49 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ncbp2Q9CQ49 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncbp2Q9CQ49 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncbp2Q9CQ49 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncbp2Q9CQ49 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncbp2Q9CQ49 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncbp2Q9CQ49 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncbp2Q9CQ49 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncbp2Q9CQ49 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncbp2Q9CQ49 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncbp2Q9CQ49 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncbp2Q9CQ49 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncbp2Q9CQ49 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncbp2Q9CQ49 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncbp2Q9CQ49 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncbp2Q9CQ49 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncbp2Q9CQ49 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncbp2Q9CQ49 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncbp2Q9CQ49 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncbp2Q9CQ49 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncbp2Q9CQ49 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncbp2Q9CQ49 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncbp2Q9CQ49 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncbp2Q9CQ49 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncbp2Q9CQ49 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncbp2Q9CQ49 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncbp2Q9CQ49 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncbp2Q9CQ49 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncbp2Q9CQ49 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncbp2Q9CQ49 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncbp2Q9CQ49 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncbp2Q9CQ49 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncbp2Q9CQ49 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncbp2Q9CQ49 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncbp2Q9CQ49 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncbp2Q9CQ49 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncbp2Q9CQ49 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms