Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mid1ip1Q9CQ20 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mid1ip1Q9CQ20 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mid1ip1Q9CQ20 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mid1ip1Q9CQ20 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mid1ip1Q9CQ20 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mid1ip1Q9CQ20 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mid1ip1Q9CQ20 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mid1ip1Q9CQ20 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mid1ip1Q9CQ20 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mid1ip1Q9CQ20 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mid1ip1Q9CQ20 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mid1ip1Q9CQ20 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mid1ip1Q9CQ20 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mid1ip1Q9CQ20 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mid1ip1Q9CQ20 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mid1ip1Q9CQ20 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mid1ip1Q9CQ20 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mid1ip1Q9CQ20 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mid1ip1Q9CQ20 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mid1ip1Q9CQ20 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mid1ip1Q9CQ20 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mid1ip1Q9CQ20 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mid1ip1Q9CQ20 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mid1ip1Q9CQ20 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mid1ip1Q9CQ20 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mid1ip1Q9CQ20 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mid1ip1Q9CQ20 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mid1ip1Q9CQ20 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mid1ip1Q9CQ20 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mid1ip1Q9CQ20 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mid1ip1Q9CQ20 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mid1ip1Q9CQ20 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mid1ip1Q9CQ20 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mid1ip1Q9CQ20 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mid1ip1Q9CQ20 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mid1ip1Q9CQ20 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mid1ip1Q9CQ20 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mid1ip1Q9CQ20 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mid1ip1Q9CQ20 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mid1ip1Q9CQ20 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mid1ip1Q9CQ20 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mid1ip1Q9CQ20 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mid1ip1Q9CQ20 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Mid1ip1Q9CQ20 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mid1ip1Q9CQ20 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mid1ip1Q9CQ20 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mid1ip1Q9CQ20 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mid1ip1Q9CQ20 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mid1ip1Q9CQ20 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mid1ip1Q9CQ20 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mid1ip1Q9CQ20 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mid1ip1Q9CQ20 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mid1ip1Q9CQ20 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mid1ip1Q9CQ20 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mid1ip1Q9CQ20 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Mid1ip1Q9CQ20 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mid1ip1Q9CQ20 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mid1ip1Q9CQ20 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mid1ip1Q9CQ20 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mid1ip1Q9CQ20 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mid1ip1Q9CQ20 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mid1ip1Q9CQ20 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mid1ip1Q9CQ20 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mid1ip1Q9CQ20 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mid1ip1Q9CQ20 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mid1ip1Q9CQ20 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mid1ip1Q9CQ20 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mid1ip1Q9CQ20 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mid1ip1Q9CQ20 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mid1ip1Q9CQ20 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mid1ip1Q9CQ20 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Mid1ip1Q9CQ20 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mid1ip1Q9CQ20 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mid1ip1Q9CQ20 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mid1ip1Q9CQ20 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mid1ip1Q9CQ20 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mid1ip1Q9CQ20 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mid1ip1Q9CQ20 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mid1ip1Q9CQ20 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mid1ip1Q9CQ20 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mid1ip1Q9CQ20 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mid1ip1Q9CQ20 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mid1ip1Q9CQ20 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Mid1ip1Q9CQ20 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mid1ip1Q9CQ20 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mid1ip1Q9CQ20 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mid1ip1Q9CQ20 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mid1ip1Q9CQ20 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Mid1ip1Q9CQ20 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mid1ip1Q9CQ20 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mid1ip1Q9CQ20 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mid1ip1Q9CQ20 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mid1ip1Q9CQ20 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mid1ip1Q9CQ20 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mid1ip1Q9CQ20 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mid1ip1Q9CQ20 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mid1ip1Q9CQ20 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mid1ip1Q9CQ20 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms