Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ19

Myl9, Myosin regulatory light polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl9Q9CQ19 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Myl9Q9CQ19 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Myl9Q9CQ19 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Myl9Q9CQ19 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myl9Q9CQ19 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myl9Q9CQ19 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myl9Q9CQ19 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myl9Q9CQ19 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myl9Q9CQ19 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myl9Q9CQ19 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Myl9Q9CQ19 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myl9Q9CQ19 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myl9Q9CQ19 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myl9Q9CQ19 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Myl9Q9CQ19 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Myl9Q9CQ19 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Myl9Q9CQ19 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Myl9Q9CQ19 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Myl9Q9CQ19 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Myl9Q9CQ19 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Myl9Q9CQ19 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Myl9Q9CQ19 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Myl9Q9CQ19 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Myl9Q9CQ19 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Myl9Q9CQ19 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Myl9Q9CQ19 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Myl9Q9CQ19 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Myl9Q9CQ19 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Myl9Q9CQ19 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Myl9Q9CQ19 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Myl9Q9CQ19 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Myl9Q9CQ19 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Myl9Q9CQ19 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Myl9Q9CQ19 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Myl9Q9CQ19 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myl9Q9CQ19 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myl9Q9CQ19 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myl9Q9CQ19 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myl9Q9CQ19 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myl9Q9CQ19 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myl9Q9CQ19 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Myl9Q9CQ19 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myl9Q9CQ19 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myl9Q9CQ19 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Myl9Q9CQ19 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Myl9Q9CQ19 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Myl9Q9CQ19 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Myl9Q9CQ19 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Myl9Q9CQ19 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myl9Q9CQ19 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myl9Q9CQ19 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myl9Q9CQ19 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Myl9Q9CQ19 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Myl9Q9CQ19 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Myl9Q9CQ19 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Myl9Q9CQ19 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Myl9Q9CQ19 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Myl9Q9CQ19 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Myl9Q9CQ19 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Myl9Q9CQ19 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Myl9Q9CQ19 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Myl9Q9CQ19 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Myl9Q9CQ19 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Myl9Q9CQ19 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Myl9Q9CQ19 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Myl9Q9CQ19 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Myl9Q9CQ19 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Myl9Q9CQ19 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Myl9Q9CQ19 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Myl9Q9CQ19 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Myl9Q9CQ19 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Myl9Q9CQ19 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Myl9Q9CQ19 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Myl9Q9CQ19 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Myl9Q9CQ19 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Myl9Q9CQ19 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Myl9Q9CQ19 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Myl9Q9CQ19 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Myl9Q9CQ19 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Myl9Q9CQ19 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Myl9Q9CQ19 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Myl9Q9CQ19 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Myl9Q9CQ19 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Myl9Q9CQ19 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Myl9Q9CQ19 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Myl9Q9CQ19 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Myl9Q9CQ19 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Myl9Q9CQ19 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Myl9Q9CQ19 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Myl9Q9CQ19 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Myl9Q9CQ19 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Myl9Q9CQ19 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Myl9Q9CQ19 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Myl9Q9CQ19 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Myl9Q9CQ19 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Myl9Q9CQ19 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Myl9Q9CQ19 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Myl9Q9CQ19 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Myl9Q9CQ19 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Myl9Q9CQ19 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms