Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Commd4Q9CQ02 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Commd4Q9CQ02 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Commd4Q9CQ02 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Commd4Q9CQ02 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Commd4Q9CQ02 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Commd4Q9CQ02 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Commd4Q9CQ02 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Commd4Q9CQ02 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Commd4Q9CQ02 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Commd4Q9CQ02 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Commd4Q9CQ02 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Commd4Q9CQ02 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Commd4Q9CQ02 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Commd4Q9CQ02 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Commd4Q9CQ02 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Commd4Q9CQ02 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Commd4Q9CQ02 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Commd4Q9CQ02 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Commd4Q9CQ02 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Commd4Q9CQ02 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Commd4Q9CQ02 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Commd4Q9CQ02 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Commd4Q9CQ02 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Commd4Q9CQ02 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Commd4Q9CQ02 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Commd4Q9CQ02 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Commd4Q9CQ02 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Commd4Q9CQ02 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Commd4Q9CQ02 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Commd4Q9CQ02 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Commd4Q9CQ02 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Commd4Q9CQ02 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Commd4Q9CQ02 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Commd4Q9CQ02 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Commd4Q9CQ02 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Commd4Q9CQ02 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Commd4Q9CQ02 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Commd4Q9CQ02 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Commd4Q9CQ02 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Commd4Q9CQ02 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Commd4Q9CQ02 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Commd4Q9CQ02 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Commd4Q9CQ02 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Commd4Q9CQ02 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Commd4Q9CQ02 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Commd4Q9CQ02 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Commd4Q9CQ02 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Commd4Q9CQ02 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Commd4Q9CQ02 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Commd4Q9CQ02 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Commd4Q9CQ02 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Commd4Q9CQ02 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Commd4Q9CQ02 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Commd4Q9CQ02 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Commd4Q9CQ02 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Commd4Q9CQ02 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Commd4Q9CQ02 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Commd4Q9CQ02 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Commd4Q9CQ02 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Commd4Q9CQ02 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Commd4Q9CQ02 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Commd4Q9CQ02 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Commd4Q9CQ02 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Commd4Q9CQ02 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Commd4Q9CQ02 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Commd4Q9CQ02 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Commd4Q9CQ02 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Commd4Q9CQ02 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Commd4Q9CQ02 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Commd4Q9CQ02 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Commd4Q9CQ02 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Commd4Q9CQ02 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Commd4Q9CQ02 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Commd4Q9CQ02 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Commd4Q9CQ02 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Commd4Q9CQ02 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Commd4Q9CQ02 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Commd4Q9CQ02 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Commd4Q9CQ02 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Commd4Q9CQ02 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Commd4Q9CQ02 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Commd4Q9CQ02 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Commd4Q9CQ02 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Commd4Q9CQ02 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Commd4Q9CQ02 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Commd4Q9CQ02 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Commd4Q9CQ02 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Commd4Q9CQ02 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Commd4Q9CQ02 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Commd4Q9CQ02 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Commd4Q9CQ02 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Commd4Q9CQ02 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Commd4Q9CQ02 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Commd4Q9CQ02 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Commd4Q9CQ02 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Commd4Q9CQ02 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Commd4Q9CQ02 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Commd4Q9CQ02 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Commd4Q9CQ02 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms