Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gtf2a1Q99PM3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gtf2a1Q99PM3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gtf2a1Q99PM3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gtf2a1Q99PM3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Gtf2a1Q99PM3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gtf2a1Q99PM3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtf2a1Q99PM3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtf2a1Q99PM3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtf2a1Q99PM3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtf2a1Q99PM3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtf2a1Q99PM3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gtf2a1Q99PM3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gtf2a1Q99PM3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gtf2a1Q99PM3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtf2a1Q99PM3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gtf2a1Q99PM3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gtf2a1Q99PM3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gtf2a1Q99PM3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gtf2a1Q99PM3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gtf2a1Q99PM3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gtf2a1Q99PM3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gtf2a1Q99PM3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gtf2a1Q99PM3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gtf2a1Q99PM3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gtf2a1Q99PM3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gtf2a1Q99PM3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gtf2a1Q99PM3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gtf2a1Q99PM3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gtf2a1Q99PM3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gtf2a1Q99PM3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gtf2a1Q99PM3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gtf2a1Q99PM3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gtf2a1Q99PM3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gtf2a1Q99PM3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gtf2a1Q99PM3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gtf2a1Q99PM3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gtf2a1Q99PM3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gtf2a1Q99PM3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gtf2a1Q99PM3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gtf2a1Q99PM3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gtf2a1Q99PM3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gtf2a1Q99PM3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gtf2a1Q99PM3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gtf2a1Q99PM3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gtf2a1Q99PM3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gtf2a1Q99PM3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gtf2a1Q99PM3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gtf2a1Q99PM3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gtf2a1Q99PM3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gtf2a1Q99PM3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gtf2a1Q99PM3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Gtf2a1Q99PM3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gtf2a1Q99PM3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gtf2a1Q99PM3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gtf2a1Q99PM3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gtf2a1Q99PM3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gtf2a1Q99PM3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtf2a1Q99PM3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf2a1Q99PM3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtf2a1Q99PM3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtf2a1Q99PM3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtf2a1Q99PM3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gtf2a1Q99PM3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gtf2a1Q99PM3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gtf2a1Q99PM3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtf2a1Q99PM3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtf2a1Q99PM3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtf2a1Q99PM3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtf2a1Q99PM3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtf2a1Q99PM3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtf2a1Q99PM3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtf2a1Q99PM3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtf2a1Q99PM3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtf2a1Q99PM3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtf2a1Q99PM3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtf2a1Q99PM3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtf2a1Q99PM3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gtf2a1Q99PM3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gtf2a1Q99PM3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gtf2a1Q99PM3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gtf2a1Q99PM3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gtf2a1Q99PM3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gtf2a1Q99PM3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gtf2a1Q99PM3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf2a1Q99PM3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf2a1Q99PM3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf2a1Q99PM3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf2a1Q99PM3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf2a1Q99PM3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf2a1Q99PM3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf2a1Q99PM3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf2a1Q99PM3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf2a1Q99PM3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf2a1Q99PM3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf2a1Q99PM3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms