Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Pcgf6Q99NA9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Pcgf6Q99NA9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Pcgf6Q99NA9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Pcgf6Q99NA9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Pcgf6Q99NA9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Pcgf6Q99NA9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Pcgf6Q99NA9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Pcgf6Q99NA9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Pcgf6Q99NA9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Pcgf6Q99NA9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Pcgf6Q99NA9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Pcgf6Q99NA9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Pcgf6Q99NA9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Pcgf6Q99NA9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Pcgf6Q99NA9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Pcgf6Q99NA9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Pcgf6Q99NA9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Pcgf6Q99NA9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Pcgf6Q99NA9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Pcgf6Q99NA9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Pcgf6Q99NA9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Pcgf6Q99NA9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Pcgf6Q99NA9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Pcgf6Q99NA9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Pcgf6Q99NA9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Pcgf6Q99NA9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Pcgf6Q99NA9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Pcgf6Q99NA9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Pcgf6Q99NA9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Pcgf6Q99NA9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Pcgf6Q99NA9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Pcgf6Q99NA9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Pcgf6Q99NA9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Pcgf6Q99NA9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Pcgf6Q99NA9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Pcgf6Q99NA9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Pcgf6Q99NA9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Pcgf6Q99NA9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Pcgf6Q99NA9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Pcgf6Q99NA9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Pcgf6Q99NA9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Pcgf6Q99NA9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Pcgf6Q99NA9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Pcgf6Q99NA9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Pcgf6Q99NA9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Pcgf6Q99NA9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Pcgf6Q99NA9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Pcgf6Q99NA9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Pcgf6Q99NA9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Pcgf6Q99NA9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Pcgf6Q99NA9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Pcgf6Q99NA9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Pcgf6Q99NA9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Pcgf6Q99NA9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Pcgf6Q99NA9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Pcgf6Q99NA9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Pcgf6Q99NA9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Pcgf6Q99NA9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Pcgf6Q99NA9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Pcgf6Q99NA9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Pcgf6Q99NA9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Pcgf6Q99NA9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Pcgf6Q99NA9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Pcgf6Q99NA9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Pcgf6Q99NA9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Pcgf6Q99NA9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Pcgf6Q99NA9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Pcgf6Q99NA9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Pcgf6Q99NA9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Pcgf6Q99NA9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Pcgf6Q99NA9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Pcgf6Q99NA9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Pcgf6Q99NA9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Pcgf6Q99NA9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Pcgf6Q99NA9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Pcgf6Q99NA9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Pcgf6Q99NA9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Pcgf6Q99NA9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Pcgf6Q99NA9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Pcgf6Q99NA9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Pcgf6Q99NA9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Pcgf6Q99NA9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Pcgf6Q99NA9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Pcgf6Q99NA9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Pcgf6Q99NA9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Pcgf6Q99NA9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Pcgf6Q99NA9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Pcgf6Q99NA9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Pcgf6Q99NA9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Pcgf6Q99NA9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Pcgf6Q99NA9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Pcgf6Q99NA9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Pcgf6Q99NA9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Pcgf6Q99NA9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Pcgf6Q99NA9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Pcgf6Q99NA9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Pcgf6Q99NA9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Pcgf6Q99NA9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Pcgf6Q99NA9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms