Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Brms1Q99N20 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Brms1Q99N20 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Brms1Q99N20 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Brms1Q99N20 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Brms1Q99N20 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Brms1Q99N20 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Brms1Q99N20 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Brms1Q99N20 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Brms1Q99N20 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Brms1Q99N20 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Brms1Q99N20 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Brms1Q99N20 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Brms1Q99N20 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Brms1Q99N20 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Brms1Q99N20 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Brms1Q99N20 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Brms1Q99N20 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Brms1Q99N20 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Brms1Q99N20 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Brms1Q99N20 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Brms1Q99N20 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Brms1Q99N20 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Brms1Q99N20 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Brms1Q99N20 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Brms1Q99N20 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Brms1Q99N20 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Brms1Q99N20 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Brms1Q99N20 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Brms1Q99N20 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Brms1Q99N20 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Brms1Q99N20 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Brms1Q99N20 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Brms1Q99N20 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Brms1Q99N20 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Brms1Q99N20 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Brms1Q99N20 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Brms1Q99N20 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Brms1Q99N20 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Brms1Q99N20 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Brms1Q99N20 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Brms1Q99N20 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Brms1Q99N20 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Brms1Q99N20 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Brms1Q99N20 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Brms1Q99N20 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Brms1Q99N20 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Brms1Q99N20 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Brms1Q99N20 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Brms1Q99N20 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Brms1Q99N20 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Brms1Q99N20 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Brms1Q99N20 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Brms1Q99N20 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Brms1Q99N20 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Brms1Q99N20 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Brms1Q99N20 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Brms1Q99N20 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Brms1Q99N20 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Brms1Q99N20 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Brms1Q99N20 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Brms1Q99N20 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Brms1Q99N20 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Brms1Q99N20 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Brms1Q99N20 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Brms1Q99N20 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Brms1Q99N20 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Brms1Q99N20 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Brms1Q99N20 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Brms1Q99N20 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Brms1Q99N20 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Brms1Q99N20 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Brms1Q99N20 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Brms1Q99N20 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Brms1Q99N20 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Brms1Q99N20 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Brms1Q99N20 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Brms1Q99N20 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Brms1Q99N20 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Brms1Q99N20 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Brms1Q99N20 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Brms1Q99N20 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Brms1Q99N20 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Brms1Q99N20 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Brms1Q99N20 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Brms1Q99N20 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Brms1Q99N20 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Brms1Q99N20 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Brms1Q99N20 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Brms1Q99N20 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Brms1Q99N20 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Brms1Q99N20 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Brms1Q99N20 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Brms1Q99N20 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Brms1Q99N20 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Brms1Q99N20 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Brms1Q99N20 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Brms1Q99N20 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Brms1Q99N20 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Brms1Q99N20 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms