Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Atp1b4Q99ME6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Atp1b4Q99ME6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Atp1b4Q99ME6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Atp1b4Q99ME6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Atp1b4Q99ME6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Atp1b4Q99ME6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Atp1b4Q99ME6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Atp1b4Q99ME6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Atp1b4Q99ME6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Atp1b4Q99ME6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Atp1b4Q99ME6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Atp1b4Q99ME6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Atp1b4Q99ME6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Atp1b4Q99ME6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Atp1b4Q99ME6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Atp1b4Q99ME6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Atp1b4Q99ME6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Atp1b4Q99ME6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Atp1b4Q99ME6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Atp1b4Q99ME6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Atp1b4Q99ME6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Atp1b4Q99ME6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Atp1b4Q99ME6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Atp1b4Q99ME6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Atp1b4Q99ME6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Atp1b4Q99ME6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Atp1b4Q99ME6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Atp1b4Q99ME6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Atp1b4Q99ME6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Atp1b4Q99ME6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Atp1b4Q99ME6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Atp1b4Q99ME6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Atp1b4Q99ME6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Atp1b4Q99ME6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Atp1b4Q99ME6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Atp1b4Q99ME6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Atp1b4Q99ME6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Atp1b4Q99ME6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Atp1b4Q99ME6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Atp1b4Q99ME6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Atp1b4Q99ME6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Atp1b4Q99ME6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Atp1b4Q99ME6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Atp1b4Q99ME6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Atp1b4Q99ME6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Atp1b4Q99ME6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Atp1b4Q99ME6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Atp1b4Q99ME6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Atp1b4Q99ME6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Atp1b4Q99ME6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Atp1b4Q99ME6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Atp1b4Q99ME6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Atp1b4Q99ME6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Atp1b4Q99ME6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Atp1b4Q99ME6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Atp1b4Q99ME6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Atp1b4Q99ME6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Atp1b4Q99ME6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Atp1b4Q99ME6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Atp1b4Q99ME6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Atp1b4Q99ME6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Atp1b4Q99ME6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Atp1b4Q99ME6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Atp1b4Q99ME6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
Atp1b4Q99ME6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Atp1b4Q99ME6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Atp1b4Q99ME6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Atp1b4Q99ME6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Atp1b4Q99ME6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Atp1b4Q99ME6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Atp1b4Q99ME6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Atp1b4Q99ME6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Atp1b4Q99ME6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Atp1b4Q99ME6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Atp1b4Q99ME6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Atp1b4Q99ME6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Atp1b4Q99ME6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Atp1b4Q99ME6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Atp1b4Q99ME6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Atp1b4Q99ME6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Atp1b4Q99ME6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Atp1b4Q99ME6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Atp1b4Q99ME6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Atp1b4Q99ME6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Atp1b4Q99ME6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Atp1b4Q99ME6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Atp1b4Q99ME6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Atp1b4Q99ME6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Atp1b4Q99ME6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Atp1b4Q99ME6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Atp1b4Q99ME6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Atp1b4Q99ME6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Atp1b4Q99ME6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Atp1b4Q99ME6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Atp1b4Q99ME6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Atp1b4Q99ME6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Atp1b4Q99ME6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Atp1b4Q99ME6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Atp1b4Q99ME6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms