Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tlr3Q99MB1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tlr3Q99MB1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tlr3Q99MB1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tlr3Q99MB1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tlr3Q99MB1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tlr3Q99MB1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tlr3Q99MB1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tlr3Q99MB1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tlr3Q99MB1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tlr3Q99MB1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tlr3Q99MB1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Tlr3Q99MB1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tlr3Q99MB1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tlr3Q99MB1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tlr3Q99MB1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tlr3Q99MB1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tlr3Q99MB1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tlr3Q99MB1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tlr3Q99MB1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Tlr3Q99MB1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tlr3Q99MB1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tlr3Q99MB1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Tlr3Q99MB1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tlr3Q99MB1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tlr3Q99MB1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tlr3Q99MB1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tlr3Q99MB1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tlr3Q99MB1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tlr3Q99MB1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tlr3Q99MB1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tlr3Q99MB1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tlr3Q99MB1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tlr3Q99MB1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tlr3Q99MB1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tlr3Q99MB1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tlr3Q99MB1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tlr3Q99MB1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tlr3Q99MB1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tlr3Q99MB1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tlr3Q99MB1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tlr3Q99MB1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tlr3Q99MB1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tlr3Q99MB1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tlr3Q99MB1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tlr3Q99MB1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tlr3Q99MB1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tlr3Q99MB1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Tlr3Q99MB1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tlr3Q99MB1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tlr3Q99MB1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tlr3Q99MB1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tlr3Q99MB1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tlr3Q99MB1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tlr3Q99MB1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tlr3Q99MB1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tlr3Q99MB1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tlr3Q99MB1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tlr3Q99MB1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tlr3Q99MB1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tlr3Q99MB1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tlr3Q99MB1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tlr3Q99MB1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tlr3Q99MB1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tlr3Q99MB1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tlr3Q99MB1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tlr3Q99MB1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tlr3Q99MB1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tlr3Q99MB1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tlr3Q99MB1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tlr3Q99MB1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tlr3Q99MB1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tlr3Q99MB1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tlr3Q99MB1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tlr3Q99MB1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tlr3Q99MB1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tlr3Q99MB1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tlr3Q99MB1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tlr3Q99MB1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tlr3Q99MB1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Tlr3Q99MB1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tlr3Q99MB1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tlr3Q99MB1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tlr3Q99MB1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tlr3Q99MB1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tlr3Q99MB1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tlr3Q99MB1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tlr3Q99MB1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tlr3Q99MB1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tlr3Q99MB1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tlr3Q99MB1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tlr3Q99MB1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tlr3Q99MB1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tlr3Q99MB1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tlr3Q99MB1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tlr3Q99MB1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tlr3Q99MB1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tlr3Q99MB1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tlr3Q99MB1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tlr3Q99MB1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms