Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdpd3Q99LY2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdpd3Q99LY2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdpd3Q99LY2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdpd3Q99LY2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gdpd3Q99LY2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gdpd3Q99LY2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gdpd3Q99LY2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gdpd3Q99LY2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gdpd3Q99LY2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdpd3Q99LY2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdpd3Q99LY2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdpd3Q99LY2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdpd3Q99LY2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdpd3Q99LY2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdpd3Q99LY2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gdpd3Q99LY2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gdpd3Q99LY2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gdpd3Q99LY2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdpd3Q99LY2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdpd3Q99LY2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdpd3Q99LY2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdpd3Q99LY2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdpd3Q99LY2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdpd3Q99LY2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdpd3Q99LY2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdpd3Q99LY2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdpd3Q99LY2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdpd3Q99LY2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdpd3Q99LY2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdpd3Q99LY2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdpd3Q99LY2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gdpd3Q99LY2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gdpd3Q99LY2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gdpd3Q99LY2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gdpd3Q99LY2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gdpd3Q99LY2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdpd3Q99LY2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdpd3Q99LY2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdpd3Q99LY2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdpd3Q99LY2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdpd3Q99LY2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdpd3Q99LY2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdpd3Q99LY2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdpd3Q99LY2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdpd3Q99LY2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdpd3Q99LY2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdpd3Q99LY2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gdpd3Q99LY2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gdpd3Q99LY2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdpd3Q99LY2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gdpd3Q99LY2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gdpd3Q99LY2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdpd3Q99LY2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdpd3Q99LY2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gdpd3Q99LY2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdpd3Q99LY2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gdpd3Q99LY2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdpd3Q99LY2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gdpd3Q99LY2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdpd3Q99LY2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdpd3Q99LY2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gdpd3Q99LY2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdpd3Q99LY2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdpd3Q99LY2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gdpd3Q99LY2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gdpd3Q99LY2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdpd3Q99LY2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdpd3Q99LY2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdpd3Q99LY2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdpd3Q99LY2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdpd3Q99LY2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdpd3Q99LY2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdpd3Q99LY2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdpd3Q99LY2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdpd3Q99LY2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdpd3Q99LY2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdpd3Q99LY2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdpd3Q99LY2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdpd3Q99LY2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdpd3Q99LY2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdpd3Q99LY2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdpd3Q99LY2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gdpd3Q99LY2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gdpd3Q99LY2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gdpd3Q99LY2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gdpd3Q99LY2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdpd3Q99LY2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdpd3Q99LY2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdpd3Q99LY2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdpd3Q99LY2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdpd3Q99LY2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdpd3Q99LY2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdpd3Q99LY2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdpd3Q99LY2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdpd3Q99LY2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdpd3Q99LY2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gdpd3Q99LY2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gdpd3Q99LY2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms