Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cmtm3Q99LJ5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cmtm3Q99LJ5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cmtm3Q99LJ5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cmtm3Q99LJ5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cmtm3Q99LJ5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cmtm3Q99LJ5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cmtm3Q99LJ5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cmtm3Q99LJ5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cmtm3Q99LJ5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cmtm3Q99LJ5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cmtm3Q99LJ5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cmtm3Q99LJ5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cmtm3Q99LJ5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cmtm3Q99LJ5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cmtm3Q99LJ5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cmtm3Q99LJ5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cmtm3Q99LJ5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmtm3Q99LJ5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmtm3Q99LJ5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmtm3Q99LJ5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmtm3Q99LJ5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmtm3Q99LJ5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmtm3Q99LJ5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmtm3Q99LJ5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmtm3Q99LJ5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmtm3Q99LJ5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmtm3Q99LJ5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtm3Q99LJ5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm3Q99LJ5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm3Q99LJ5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm3Q99LJ5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm3Q99LJ5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtm3Q99LJ5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtm3Q99LJ5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtm3Q99LJ5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtm3Q99LJ5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtm3Q99LJ5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtm3Q99LJ5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmtm3Q99LJ5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmtm3Q99LJ5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmtm3Q99LJ5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmtm3Q99LJ5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cmtm3Q99LJ5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cmtm3Q99LJ5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cmtm3Q99LJ5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cmtm3Q99LJ5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cmtm3Q99LJ5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cmtm3Q99LJ5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cmtm3Q99LJ5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cmtm3Q99LJ5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cmtm3Q99LJ5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cmtm3Q99LJ5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cmtm3Q99LJ5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cmtm3Q99LJ5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cmtm3Q99LJ5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cmtm3Q99LJ5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cmtm3Q99LJ5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cmtm3Q99LJ5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cmtm3Q99LJ5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cmtm3Q99LJ5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cmtm3Q99LJ5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cmtm3Q99LJ5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cmtm3Q99LJ5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cmtm3Q99LJ5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cmtm3Q99LJ5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cmtm3Q99LJ5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cmtm3Q99LJ5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cmtm3Q99LJ5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cmtm3Q99LJ5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cmtm3Q99LJ5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cmtm3Q99LJ5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cmtm3Q99LJ5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cmtm3Q99LJ5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cmtm3Q99LJ5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cmtm3Q99LJ5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cmtm3Q99LJ5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cmtm3Q99LJ5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmtm3Q99LJ5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmtm3Q99LJ5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmtm3Q99LJ5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmtm3Q99LJ5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmtm3Q99LJ5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cmtm3Q99LJ5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cmtm3Q99LJ5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cmtm3Q99LJ5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cmtm3Q99LJ5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cmtm3Q99LJ5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cmtm3Q99LJ5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cmtm3Q99LJ5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cmtm3Q99LJ5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cmtm3Q99LJ5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cmtm3Q99LJ5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cmtm3Q99LJ5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cmtm3Q99LJ5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cmtm3Q99LJ5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cmtm3Q99LJ5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cmtm3Q99LJ5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cmtm3Q99LJ5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cmtm3Q99LJ5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms