Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ5

Tcf19, Transcription factor 19-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf19Q99KJ5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcf19Q99KJ5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcf19Q99KJ5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcf19Q99KJ5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcf19Q99KJ5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcf19Q99KJ5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcf19Q99KJ5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcf19Q99KJ5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcf19Q99KJ5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcf19Q99KJ5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcf19Q99KJ5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcf19Q99KJ5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcf19Q99KJ5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcf19Q99KJ5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcf19Q99KJ5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcf19Q99KJ5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcf19Q99KJ5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcf19Q99KJ5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcf19Q99KJ5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcf19Q99KJ5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcf19Q99KJ5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcf19Q99KJ5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcf19Q99KJ5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcf19Q99KJ5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcf19Q99KJ5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcf19Q99KJ5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcf19Q99KJ5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcf19Q99KJ5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcf19Q99KJ5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcf19Q99KJ5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcf19Q99KJ5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcf19Q99KJ5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcf19Q99KJ5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcf19Q99KJ5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcf19Q99KJ5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcf19Q99KJ5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcf19Q99KJ5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcf19Q99KJ5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcf19Q99KJ5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcf19Q99KJ5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcf19Q99KJ5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcf19Q99KJ5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcf19Q99KJ5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcf19Q99KJ5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcf19Q99KJ5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcf19Q99KJ5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcf19Q99KJ5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcf19Q99KJ5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcf19Q99KJ5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcf19Q99KJ5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcf19Q99KJ5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcf19Q99KJ5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcf19Q99KJ5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcf19Q99KJ5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcf19Q99KJ5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcf19Q99KJ5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tcf19Q99KJ5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tcf19Q99KJ5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tcf19Q99KJ5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcf19Q99KJ5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcf19Q99KJ5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcf19Q99KJ5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcf19Q99KJ5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcf19Q99KJ5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcf19Q99KJ5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcf19Q99KJ5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcf19Q99KJ5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcf19Q99KJ5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcf19Q99KJ5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcf19Q99KJ5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcf19Q99KJ5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcf19Q99KJ5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcf19Q99KJ5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcf19Q99KJ5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcf19Q99KJ5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcf19Q99KJ5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcf19Q99KJ5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcf19Q99KJ5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcf19Q99KJ5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcf19Q99KJ5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcf19Q99KJ5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcf19Q99KJ5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcf19Q99KJ5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcf19Q99KJ5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcf19Q99KJ5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcf19Q99KJ5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcf19Q99KJ5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcf19Q99KJ5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcf19Q99KJ5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcf19Q99KJ5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcf19Q99KJ5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcf19Q99KJ5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tcf19Q99KJ5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcf19Q99KJ5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcf19Q99KJ5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcf19Q99KJ5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcf19Q99KJ5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcf19Q99KJ5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcf19Q99KJ5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcf19Q99KJ5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms