Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed9Q99KF1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed9Q99KF1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed9Q99KF1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed9Q99KF1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed9Q99KF1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed9Q99KF1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed9Q99KF1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed9Q99KF1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tmed9Q99KF1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmed9Q99KF1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed9Q99KF1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed9Q99KF1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed9Q99KF1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed9Q99KF1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed9Q99KF1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed9Q99KF1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed9Q99KF1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed9Q99KF1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed9Q99KF1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed9Q99KF1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmed9Q99KF1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmed9Q99KF1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmed9Q99KF1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmed9Q99KF1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed9Q99KF1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmed9Q99KF1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmed9Q99KF1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmed9Q99KF1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmed9Q99KF1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmed9Q99KF1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmed9Q99KF1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed9Q99KF1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed9Q99KF1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed9Q99KF1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmed9Q99KF1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmed9Q99KF1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmed9Q99KF1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmed9Q99KF1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmed9Q99KF1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmed9Q99KF1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed9Q99KF1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed9Q99KF1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed9Q99KF1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed9Q99KF1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmed9Q99KF1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmed9Q99KF1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmed9Q99KF1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmed9Q99KF1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmed9Q99KF1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmed9Q99KF1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmed9Q99KF1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmed9Q99KF1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed9Q99KF1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed9Q99KF1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed9Q99KF1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed9Q99KF1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed9Q99KF1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed9Q99KF1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmed9Q99KF1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmed9Q99KF1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmed9Q99KF1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmed9Q99KF1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmed9Q99KF1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed9Q99KF1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed9Q99KF1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed9Q99KF1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed9Q99KF1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed9Q99KF1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed9Q99KF1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed9Q99KF1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmed9Q99KF1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmed9Q99KF1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmed9Q99KF1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmed9Q99KF1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmed9Q99KF1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmed9Q99KF1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmed9Q99KF1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmed9Q99KF1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmed9Q99KF1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmed9Q99KF1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmed9Q99KF1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmed9Q99KF1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmed9Q99KF1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmed9Q99KF1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmed9Q99KF1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmed9Q99KF1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmed9Q99KF1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmed9Q99KF1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmed9Q99KF1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmed9Q99KF1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmed9Q99KF1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmed9Q99KF1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmed9Q99KF1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmed9Q99KF1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmed9Q99KF1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmed9Q99KF1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmed9Q99KF1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmed9Q99KF1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmed9Q99KF1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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