Protein–RNA interactions for Protein: Q99J62

Rfc4, Replication factor C subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc4Q99J62 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rfc4Q99J62 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rfc4Q99J62 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rfc4Q99J62 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rfc4Q99J62 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rfc4Q99J62 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rfc4Q99J62 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rfc4Q99J62 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rfc4Q99J62 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rfc4Q99J62 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rfc4Q99J62 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Rfc4Q99J62 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rfc4Q99J62 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rfc4Q99J62 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Rfc4Q99J62 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rfc4Q99J62 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rfc4Q99J62 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rfc4Q99J62 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rfc4Q99J62 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rfc4Q99J62 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rfc4Q99J62 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Rfc4Q99J62 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rfc4Q99J62 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rfc4Q99J62 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rfc4Q99J62 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rfc4Q99J62 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rfc4Q99J62 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rfc4Q99J62 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rfc4Q99J62 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rfc4Q99J62 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rfc4Q99J62 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rfc4Q99J62 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rfc4Q99J62 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rfc4Q99J62 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rfc4Q99J62 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rfc4Q99J62 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rfc4Q99J62 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rfc4Q99J62 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rfc4Q99J62 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rfc4Q99J62 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rfc4Q99J62 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rfc4Q99J62 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rfc4Q99J62 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rfc4Q99J62 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rfc4Q99J62 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rfc4Q99J62 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rfc4Q99J62 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Rfc4Q99J62 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rfc4Q99J62 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rfc4Q99J62 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rfc4Q99J62 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rfc4Q99J62 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rfc4Q99J62 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rfc4Q99J62 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rfc4Q99J62 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rfc4Q99J62 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rfc4Q99J62 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rfc4Q99J62 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rfc4Q99J62 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rfc4Q99J62 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rfc4Q99J62 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rfc4Q99J62 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rfc4Q99J62 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rfc4Q99J62 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rfc4Q99J62 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rfc4Q99J62 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rfc4Q99J62 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rfc4Q99J62 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rfc4Q99J62 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rfc4Q99J62 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rfc4Q99J62 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rfc4Q99J62 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rfc4Q99J62 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rfc4Q99J62 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rfc4Q99J62 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rfc4Q99J62 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rfc4Q99J62 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rfc4Q99J62 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rfc4Q99J62 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rfc4Q99J62 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rfc4Q99J62 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Rfc4Q99J62 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rfc4Q99J62 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rfc4Q99J62 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rfc4Q99J62 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rfc4Q99J62 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rfc4Q99J62 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rfc4Q99J62 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Rfc4Q99J62 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rfc4Q99J62 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rfc4Q99J62 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rfc4Q99J62 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rfc4Q99J62 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rfc4Q99J62 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rfc4Q99J62 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rfc4Q99J62 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rfc4Q99J62 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rfc4Q99J62 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rfc4Q99J62 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rfc4Q99J62 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms