Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf112Q96DY5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf112Q96DY5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf112Q96DY5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf112Q96DY5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf112Q96DY5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf112Q96DY5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf112Q96DY5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf112Q96DY5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf112Q96DY5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf112Q96DY5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf112Q96DY5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf112Q96DY5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf112Q96DY5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf112Q96DY5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf112Q96DY5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf112Q96DY5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rnf112Q96DY5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnf112Q96DY5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf112Q96DY5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf112Q96DY5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf112Q96DY5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf112Q96DY5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf112Q96DY5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnf112Q96DY5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnf112Q96DY5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnf112Q96DY5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnf112Q96DY5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnf112Q96DY5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnf112Q96DY5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnf112Q96DY5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rnf112Q96DY5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf112Q96DY5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf112Q96DY5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf112Q96DY5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf112Q96DY5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf112Q96DY5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf112Q96DY5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf112Q96DY5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf112Q96DY5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf112Q96DY5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf112Q96DY5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf112Q96DY5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf112Q96DY5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rnf112Q96DY5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rnf112Q96DY5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rnf112Q96DY5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rnf112Q96DY5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf112Q96DY5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf112Q96DY5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf112Q96DY5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf112Q96DY5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf112Q96DY5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf112Q96DY5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf112Q96DY5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf112Q96DY5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf112Q96DY5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf112Q96DY5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf112Q96DY5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf112Q96DY5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf112Q96DY5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf112Q96DY5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf112Q96DY5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf112Q96DY5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf112Q96DY5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf112Q96DY5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf112Q96DY5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf112Q96DY5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf112Q96DY5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf112Q96DY5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf112Q96DY5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf112Q96DY5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf112Q96DY5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf112Q96DY5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf112Q96DY5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf112Q96DY5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf112Q96DY5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf112Q96DY5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf112Q96DY5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf112Q96DY5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf112Q96DY5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf112Q96DY5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf112Q96DY5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf112Q96DY5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf112Q96DY5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf112Q96DY5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf112Q96DY5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf112Q96DY5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf112Q96DY5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf112Q96DY5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf112Q96DY5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf112Q96DY5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf112Q96DY5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf112Q96DY5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf112Q96DY5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf112Q96DY5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf112Q96DY5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf112Q96DY5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf112Q96DY5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf112Q96DY5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms