Protein–RNA interactions for Protein: Q924S9

Ripply3, Protein ripply3, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply3Q924S9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ripply3Q924S9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ripply3Q924S9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ripply3Q924S9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ripply3Q924S9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ripply3Q924S9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ripply3Q924S9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ripply3Q924S9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ripply3Q924S9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ripply3Q924S9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ripply3Q924S9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ripply3Q924S9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ripply3Q924S9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ripply3Q924S9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ripply3Q924S9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ripply3Q924S9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ripply3Q924S9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ripply3Q924S9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ripply3Q924S9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ripply3Q924S9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ripply3Q924S9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ripply3Q924S9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ripply3Q924S9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ripply3Q924S9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ripply3Q924S9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ripply3Q924S9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ripply3Q924S9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ripply3Q924S9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ripply3Q924S9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ripply3Q924S9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ripply3Q924S9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ripply3Q924S9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ripply3Q924S9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ripply3Q924S9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ripply3Q924S9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ripply3Q924S9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ripply3Q924S9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ripply3Q924S9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ripply3Q924S9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ripply3Q924S9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ripply3Q924S9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ripply3Q924S9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ripply3Q924S9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ripply3Q924S9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ripply3Q924S9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ripply3Q924S9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ripply3Q924S9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ripply3Q924S9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ripply3Q924S9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ripply3Q924S9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ripply3Q924S9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ripply3Q924S9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ripply3Q924S9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ripply3Q924S9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ripply3Q924S9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ripply3Q924S9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ripply3Q924S9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ripply3Q924S9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ripply3Q924S9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ripply3Q924S9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ripply3Q924S9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ripply3Q924S9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ripply3Q924S9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ripply3Q924S9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ripply3Q924S9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ripply3Q924S9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ripply3Q924S9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ripply3Q924S9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ripply3Q924S9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ripply3Q924S9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ripply3Q924S9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ripply3Q924S9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ripply3Q924S9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ripply3Q924S9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ripply3Q924S9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ripply3Q924S9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ripply3Q924S9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ripply3Q924S9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ripply3Q924S9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ripply3Q924S9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ripply3Q924S9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ripply3Q924S9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ripply3Q924S9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ripply3Q924S9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ripply3Q924S9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ripply3Q924S9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ripply3Q924S9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ripply3Q924S9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ripply3Q924S9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ripply3Q924S9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ripply3Q924S9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ripply3Q924S9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ripply3Q924S9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ripply3Q924S9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ripply3Q924S9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ripply3Q924S9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ripply3Q924S9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ripply3Q924S9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ripply3Q924S9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ripply3Q924S9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.5 ms