Protein–RNA interactions for Protein: Q923S6

Neurl1, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1Q923S6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neurl1Q923S6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neurl1Q923S6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Neurl1Q923S6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Neurl1Q923S6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Neurl1Q923S6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Neurl1Q923S6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurl1Q923S6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurl1Q923S6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurl1Q923S6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurl1Q923S6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurl1Q923S6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurl1Q923S6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Neurl1Q923S6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Neurl1Q923S6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Neurl1Q923S6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Neurl1Q923S6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Neurl1Q923S6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Neurl1Q923S6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurl1Q923S6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurl1Q923S6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurl1Q923S6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Neurl1Q923S6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Neurl1Q923S6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Neurl1Q923S6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Neurl1Q923S6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Neurl1Q923S6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Neurl1Q923S6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Neurl1Q923S6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Neurl1Q923S6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Neurl1Q923S6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Neurl1Q923S6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Neurl1Q923S6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Neurl1Q923S6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Neurl1Q923S6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Neurl1Q923S6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Neurl1Q923S6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Neurl1Q923S6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Neurl1Q923S6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Neurl1Q923S6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Neurl1Q923S6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Neurl1Q923S6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Neurl1Q923S6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurl1Q923S6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurl1Q923S6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurl1Q923S6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Neurl1Q923S6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Neurl1Q923S6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Neurl1Q923S6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Neurl1Q923S6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Neurl1Q923S6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurl1Q923S6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurl1Q923S6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurl1Q923S6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurl1Q923S6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurl1Q923S6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurl1Q923S6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurl1Q923S6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurl1Q923S6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurl1Q923S6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurl1Q923S6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurl1Q923S6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurl1Q923S6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurl1Q923S6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Neurl1Q923S6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurl1Q923S6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurl1Q923S6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurl1Q923S6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurl1Q923S6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurl1Q923S6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurl1Q923S6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurl1Q923S6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurl1Q923S6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Neurl1Q923S6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Neurl1Q923S6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Neurl1Q923S6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurl1Q923S6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurl1Q923S6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurl1Q923S6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurl1Q923S6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurl1Q923S6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurl1Q923S6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurl1Q923S6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurl1Q923S6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurl1Q923S6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurl1Q923S6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurl1Q923S6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Neurl1Q923S6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Neurl1Q923S6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Neurl1Q923S6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Neurl1Q923S6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Neurl1Q923S6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Neurl1Q923S6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Neurl1Q923S6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurl1Q923S6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Neurl1Q923S6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurl1Q923S6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurl1Q923S6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Neurl1Q923S6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Neurl1Q923S6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms