Protein–RNA interactions for Protein: Q923E4

Sirt1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sirt1Q923E4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Sirt1Q923E4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Sirt1Q923E4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Sirt1Q923E4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC33,13■■■□□ 2,89
Sirt1Q923E4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Sirt1Q923E4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Sirt1Q923E4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC33,11■■■□□ 2,89
Sirt1Q923E4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC33,11■■■□□ 2,89
Sirt1Q923E4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Sirt1Q923E4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC33,09■■■□□ 2,89
Sirt1Q923E4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC33,09■■■□□ 2,89
Sirt1Q923E4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,08■■■□□ 2,89
Sirt1Q923E4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
Sirt1Q923E4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC33,06■■■□□ 2,88
Sirt1Q923E4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,05■■■□□ 2,88
Sirt1Q923E4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC33,05■■■□□ 2,88
Sirt1Q923E4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Sirt1Q923E4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,05■■■□□ 2,88
Sirt1Q923E4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
Sirt1Q923E4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,04■■■□□ 2,88
Sirt1Q923E4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,03■■■□□ 2,88
Sirt1Q923E4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC33,03■■■□□ 2,88
Sirt1Q923E4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC33,03■■■□□ 2,88
Sirt1Q923E4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Sirt1Q923E4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33,02■■■□□ 2,88
Sirt1Q923E4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,87
Sirt1Q923E4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC33,01■■■□□ 2,87
Sirt1Q923E4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,87
Sirt1Q923E4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Sirt1Q923E4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Sirt1Q923E4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2,87
Sirt1Q923E4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Sirt1Q923E4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
Sirt1Q923E4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Sirt1Q923E4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Sirt1Q923E4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC32,97■■■□□ 2,87
Sirt1Q923E4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,95■■■□□ 2,87
Sirt1Q923E4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Sirt1Q923E4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Sirt1Q923E4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Sirt1Q923E4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,93■■■□□ 2,86
Sirt1Q923E4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Sirt1Q923E4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC32,9■■■□□ 2,86
Sirt1Q923E4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Sirt1Q923E4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,85
Sirt1Q923E4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC32,88■■■□□ 2,85
Sirt1Q923E4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC32,87■■■□□ 2,85
Sirt1Q923E4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
Sirt1Q923E4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC32,86■■■□□ 2,85
Sirt1Q923E4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Sirt1Q923E4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Sirt1Q923E4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Sirt1Q923E4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Sirt1Q923E4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC32,84■■■□□ 2,85
Sirt1Q923E4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Sirt1Q923E4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,84■■■□□ 2,85
Sirt1Q923E4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Sirt1Q923E4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Sirt1Q923E4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC32,83■■■□□ 2,85
Sirt1Q923E4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Sirt1Q923E4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
Sirt1Q923E4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Sirt1Q923E4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Sirt1Q923E4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Sirt1Q923E4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,79■■■□□ 2,84
Sirt1Q923E4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC32,78■■■□□ 2,84
Sirt1Q923E4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC32,78■■■□□ 2,84
Sirt1Q923E4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,78■■■□□ 2,84
Sirt1Q923E4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC32,78■■■□□ 2,84
Sirt1Q923E4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
Sirt1Q923E4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Sirt1Q923E4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC32,77■■■□□ 2,84
Sirt1Q923E4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,84
Sirt1Q923E4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Sirt1Q923E4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Sirt1Q923E4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Sirt1Q923E4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Sirt1Q923E4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Sirt1Q923E4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Sirt1Q923E4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32,73■■■□□ 2,83
Sirt1Q923E4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Sirt1Q923E4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Sirt1Q923E4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Sirt1Q923E4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Sirt1Q923E4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
Sirt1Q923E4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,83
Sirt1Q923E4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,82
Sirt1Q923E4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
Sirt1Q923E4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Sirt1Q923E4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Sirt1Q923E4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Sirt1Q923E4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Sirt1Q923E4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC32,64■■■□□ 2,82
Sirt1Q923E4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Sirt1Q923E4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Sirt1Q923E4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Sirt1Q923E4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Sirt1Q923E4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Sirt1Q923E4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Sirt1Q923E4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,4 ms