Protein–RNA interactions for Protein: Q922Q9

Chid1, Chitinase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chid1Q922Q9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chid1Q922Q9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chid1Q922Q9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chid1Q922Q9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chid1Q922Q9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chid1Q922Q9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chid1Q922Q9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chid1Q922Q9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chid1Q922Q9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chid1Q922Q9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chid1Q922Q9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chid1Q922Q9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chid1Q922Q9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chid1Q922Q9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chid1Q922Q9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Chid1Q922Q9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chid1Q922Q9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chid1Q922Q9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chid1Q922Q9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chid1Q922Q9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chid1Q922Q9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chid1Q922Q9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chid1Q922Q9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chid1Q922Q9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chid1Q922Q9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chid1Q922Q9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chid1Q922Q9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chid1Q922Q9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chid1Q922Q9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chid1Q922Q9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chid1Q922Q9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chid1Q922Q9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chid1Q922Q9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chid1Q922Q9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chid1Q922Q9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chid1Q922Q9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chid1Q922Q9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chid1Q922Q9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chid1Q922Q9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chid1Q922Q9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chid1Q922Q9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chid1Q922Q9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chid1Q922Q9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chid1Q922Q9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chid1Q922Q9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chid1Q922Q9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chid1Q922Q9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chid1Q922Q9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chid1Q922Q9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chid1Q922Q9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chid1Q922Q9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chid1Q922Q9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chid1Q922Q9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chid1Q922Q9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chid1Q922Q9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chid1Q922Q9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chid1Q922Q9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chid1Q922Q9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chid1Q922Q9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chid1Q922Q9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chid1Q922Q9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chid1Q922Q9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chid1Q922Q9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chid1Q922Q9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chid1Q922Q9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chid1Q922Q9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chid1Q922Q9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chid1Q922Q9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chid1Q922Q9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chid1Q922Q9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chid1Q922Q9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Chid1Q922Q9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chid1Q922Q9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chid1Q922Q9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chid1Q922Q9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chid1Q922Q9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chid1Q922Q9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chid1Q922Q9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chid1Q922Q9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chid1Q922Q9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chid1Q922Q9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Chid1Q922Q9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chid1Q922Q9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chid1Q922Q9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chid1Q922Q9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chid1Q922Q9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chid1Q922Q9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chid1Q922Q9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chid1Q922Q9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chid1Q922Q9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chid1Q922Q9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chid1Q922Q9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chid1Q922Q9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chid1Q922Q9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chid1Q922Q9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chid1Q922Q9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chid1Q922Q9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chid1Q922Q9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chid1Q922Q9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chid1Q922Q9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.3 ms