Protein–RNA interactions for Protein: Q922L6

Nelfcd, Negative elongation factor D, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfcdQ922L6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NelfcdQ922L6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NelfcdQ922L6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NelfcdQ922L6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NelfcdQ922L6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NelfcdQ922L6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NelfcdQ922L6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NelfcdQ922L6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NelfcdQ922L6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NelfcdQ922L6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NelfcdQ922L6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NelfcdQ922L6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NelfcdQ922L6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NelfcdQ922L6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NelfcdQ922L6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NelfcdQ922L6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NelfcdQ922L6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NelfcdQ922L6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NelfcdQ922L6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NelfcdQ922L6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NelfcdQ922L6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NelfcdQ922L6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NelfcdQ922L6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NelfcdQ922L6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NelfcdQ922L6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NelfcdQ922L6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NelfcdQ922L6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NelfcdQ922L6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NelfcdQ922L6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NelfcdQ922L6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NelfcdQ922L6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NelfcdQ922L6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NelfcdQ922L6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NelfcdQ922L6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NelfcdQ922L6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NelfcdQ922L6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NelfcdQ922L6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NelfcdQ922L6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NelfcdQ922L6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NelfcdQ922L6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NelfcdQ922L6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NelfcdQ922L6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NelfcdQ922L6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NelfcdQ922L6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NelfcdQ922L6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NelfcdQ922L6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NelfcdQ922L6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NelfcdQ922L6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NelfcdQ922L6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NelfcdQ922L6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NelfcdQ922L6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NelfcdQ922L6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NelfcdQ922L6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NelfcdQ922L6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NelfcdQ922L6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NelfcdQ922L6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NelfcdQ922L6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NelfcdQ922L6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NelfcdQ922L6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NelfcdQ922L6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NelfcdQ922L6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NelfcdQ922L6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NelfcdQ922L6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NelfcdQ922L6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NelfcdQ922L6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NelfcdQ922L6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NelfcdQ922L6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NelfcdQ922L6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NelfcdQ922L6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NelfcdQ922L6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NelfcdQ922L6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NelfcdQ922L6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NelfcdQ922L6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NelfcdQ922L6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NelfcdQ922L6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NelfcdQ922L6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NelfcdQ922L6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NelfcdQ922L6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NelfcdQ922L6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NelfcdQ922L6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NelfcdQ922L6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NelfcdQ922L6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NelfcdQ922L6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NelfcdQ922L6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NelfcdQ922L6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NelfcdQ922L6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NelfcdQ922L6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NelfcdQ922L6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NelfcdQ922L6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NelfcdQ922L6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NelfcdQ922L6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NelfcdQ922L6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NelfcdQ922L6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NelfcdQ922L6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NelfcdQ922L6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NelfcdQ922L6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NelfcdQ922L6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NelfcdQ922L6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NelfcdQ922L6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NelfcdQ922L6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
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