Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZF4

Ctsq, Cathepsin Q, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsqQ91ZF4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CtsqQ91ZF4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CtsqQ91ZF4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CtsqQ91ZF4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CtsqQ91ZF4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CtsqQ91ZF4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CtsqQ91ZF4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CtsqQ91ZF4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CtsqQ91ZF4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CtsqQ91ZF4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CtsqQ91ZF4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CtsqQ91ZF4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CtsqQ91ZF4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CtsqQ91ZF4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CtsqQ91ZF4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CtsqQ91ZF4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CtsqQ91ZF4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CtsqQ91ZF4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CtsqQ91ZF4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CtsqQ91ZF4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CtsqQ91ZF4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CtsqQ91ZF4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CtsqQ91ZF4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CtsqQ91ZF4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CtsqQ91ZF4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CtsqQ91ZF4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CtsqQ91ZF4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CtsqQ91ZF4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CtsqQ91ZF4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CtsqQ91ZF4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CtsqQ91ZF4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CtsqQ91ZF4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CtsqQ91ZF4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CtsqQ91ZF4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CtsqQ91ZF4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CtsqQ91ZF4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CtsqQ91ZF4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CtsqQ91ZF4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CtsqQ91ZF4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CtsqQ91ZF4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CtsqQ91ZF4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CtsqQ91ZF4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CtsqQ91ZF4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CtsqQ91ZF4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CtsqQ91ZF4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CtsqQ91ZF4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CtsqQ91ZF4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CtsqQ91ZF4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CtsqQ91ZF4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CtsqQ91ZF4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CtsqQ91ZF4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CtsqQ91ZF4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CtsqQ91ZF4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CtsqQ91ZF4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CtsqQ91ZF4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CtsqQ91ZF4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CtsqQ91ZF4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CtsqQ91ZF4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CtsqQ91ZF4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CtsqQ91ZF4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CtsqQ91ZF4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CtsqQ91ZF4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CtsqQ91ZF4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CtsqQ91ZF4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CtsqQ91ZF4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CtsqQ91ZF4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CtsqQ91ZF4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CtsqQ91ZF4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CtsqQ91ZF4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CtsqQ91ZF4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CtsqQ91ZF4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CtsqQ91ZF4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CtsqQ91ZF4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CtsqQ91ZF4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CtsqQ91ZF4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CtsqQ91ZF4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CtsqQ91ZF4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CtsqQ91ZF4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CtsqQ91ZF4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CtsqQ91ZF4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CtsqQ91ZF4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CtsqQ91ZF4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CtsqQ91ZF4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CtsqQ91ZF4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CtsqQ91ZF4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CtsqQ91ZF4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CtsqQ91ZF4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CtsqQ91ZF4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CtsqQ91ZF4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CtsqQ91ZF4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CtsqQ91ZF4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CtsqQ91ZF4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CtsqQ91ZF4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CtsqQ91ZF4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CtsqQ91ZF4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CtsqQ91ZF4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CtsqQ91ZF4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CtsqQ91ZF4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CtsqQ91ZF4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CtsqQ91ZF4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms