Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z69

Srgap1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap1Q91Z69 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Srgap1Q91Z69 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Srgap1Q91Z69 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Srgap1Q91Z69 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Srgap1Q91Z69 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Srgap1Q91Z69 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28,4■■■□□ 2,14
Srgap1Q91Z69 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Srgap1Q91Z69 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Srgap1Q91Z69 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Srgap1Q91Z69 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Srgap1Q91Z69 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Srgap1Q91Z69 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28,37■■■□□ 2,13
Srgap1Q91Z69 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Srgap1Q91Z69 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Srgap1Q91Z69 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Srgap1Q91Z69 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Srgap1Q91Z69 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Srgap1Q91Z69 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,33■■■□□ 2,12
Srgap1Q91Z69 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Srgap1Q91Z69 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Srgap1Q91Z69 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Srgap1Q91Z69 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Srgap1Q91Z69 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Srgap1Q91Z69 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Srgap1Q91Z69 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Srgap1Q91Z69 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Srgap1Q91Z69 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Srgap1Q91Z69 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Srgap1Q91Z69 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Srgap1Q91Z69 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Srgap1Q91Z69 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Srgap1Q91Z69 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28,26■■■□□ 2,11
Srgap1Q91Z69 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Srgap1Q91Z69 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Srgap1Q91Z69 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Srgap1Q91Z69 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Srgap1Q91Z69 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Srgap1Q91Z69 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,11
Srgap1Q91Z69 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,11
Srgap1Q91Z69 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,11
Srgap1Q91Z69 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Srgap1Q91Z69 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Srgap1Q91Z69 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Srgap1Q91Z69 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Srgap1Q91Z69 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Srgap1Q91Z69 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Srgap1Q91Z69 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Srgap1Q91Z69 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Srgap1Q91Z69 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Srgap1Q91Z69 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28,17■■■□□ 2,1
Srgap1Q91Z69 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Srgap1Q91Z69 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28,16■■■□□ 2,1
Srgap1Q91Z69 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Srgap1Q91Z69 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Srgap1Q91Z69 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Srgap1Q91Z69 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Srgap1Q91Z69 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Srgap1Q91Z69 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Srgap1Q91Z69 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Srgap1Q91Z69 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Srgap1Q91Z69 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Srgap1Q91Z69 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Srgap1Q91Z69 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Srgap1Q91Z69 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Srgap1Q91Z69 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Srgap1Q91Z69 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Srgap1Q91Z69 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Srgap1Q91Z69 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Srgap1Q91Z69 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Srgap1Q91Z69 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Srgap1Q91Z69 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Srgap1Q91Z69 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Srgap1Q91Z69 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Srgap1Q91Z69 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Srgap1Q91Z69 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Srgap1Q91Z69 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Srgap1Q91Z69 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Srgap1Q91Z69 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Srgap1Q91Z69 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Srgap1Q91Z69 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Srgap1Q91Z69 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Srgap1Q91Z69 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Srgap1Q91Z69 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Srgap1Q91Z69 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Srgap1Q91Z69 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Srgap1Q91Z69 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Srgap1Q91Z69 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Srgap1Q91Z69 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Srgap1Q91Z69 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Srgap1Q91Z69 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,08
Srgap1Q91Z69 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Srgap1Q91Z69 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Srgap1Q91Z69 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2,07
Srgap1Q91Z69 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Srgap1Q91Z69 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Srgap1Q91Z69 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Srgap1Q91Z69 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Srgap1Q91Z69 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Srgap1Q91Z69 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Srgap1Q91Z69 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms