Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prpf6Q91YR7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prpf6Q91YR7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prpf6Q91YR7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prpf6Q91YR7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prpf6Q91YR7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prpf6Q91YR7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prpf6Q91YR7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prpf6Q91YR7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prpf6Q91YR7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prpf6Q91YR7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prpf6Q91YR7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prpf6Q91YR7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prpf6Q91YR7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prpf6Q91YR7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prpf6Q91YR7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prpf6Q91YR7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prpf6Q91YR7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Prpf6Q91YR7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Prpf6Q91YR7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prpf6Q91YR7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prpf6Q91YR7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prpf6Q91YR7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prpf6Q91YR7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prpf6Q91YR7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prpf6Q91YR7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prpf6Q91YR7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Prpf6Q91YR7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prpf6Q91YR7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prpf6Q91YR7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prpf6Q91YR7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prpf6Q91YR7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prpf6Q91YR7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prpf6Q91YR7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prpf6Q91YR7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prpf6Q91YR7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prpf6Q91YR7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prpf6Q91YR7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prpf6Q91YR7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prpf6Q91YR7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prpf6Q91YR7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prpf6Q91YR7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prpf6Q91YR7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prpf6Q91YR7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prpf6Q91YR7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prpf6Q91YR7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prpf6Q91YR7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prpf6Q91YR7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Prpf6Q91YR7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prpf6Q91YR7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prpf6Q91YR7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prpf6Q91YR7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prpf6Q91YR7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prpf6Q91YR7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prpf6Q91YR7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prpf6Q91YR7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prpf6Q91YR7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prpf6Q91YR7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prpf6Q91YR7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prpf6Q91YR7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prpf6Q91YR7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Prpf6Q91YR7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prpf6Q91YR7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prpf6Q91YR7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prpf6Q91YR7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prpf6Q91YR7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prpf6Q91YR7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prpf6Q91YR7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prpf6Q91YR7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prpf6Q91YR7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Prpf6Q91YR7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Prpf6Q91YR7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prpf6Q91YR7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prpf6Q91YR7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Prpf6Q91YR7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prpf6Q91YR7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Prpf6Q91YR7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prpf6Q91YR7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prpf6Q91YR7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prpf6Q91YR7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prpf6Q91YR7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prpf6Q91YR7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prpf6Q91YR7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prpf6Q91YR7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prpf6Q91YR7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prpf6Q91YR7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prpf6Q91YR7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prpf6Q91YR7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prpf6Q91YR7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prpf6Q91YR7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prpf6Q91YR7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prpf6Q91YR7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prpf6Q91YR7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prpf6Q91YR7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prpf6Q91YR7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prpf6Q91YR7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prpf6Q91YR7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prpf6Q91YR7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prpf6Q91YR7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prpf6Q91YR7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms