Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc49Q91YK0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc49Q91YK0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc49Q91YK0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc49Q91YK0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc49Q91YK0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc49Q91YK0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc49Q91YK0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc49Q91YK0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc49Q91YK0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc49Q91YK0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc49Q91YK0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc49Q91YK0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc49Q91YK0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc49Q91YK0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc49Q91YK0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc49Q91YK0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc49Q91YK0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc49Q91YK0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc49Q91YK0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc49Q91YK0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc49Q91YK0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc49Q91YK0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc49Q91YK0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc49Q91YK0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc49Q91YK0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc49Q91YK0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc49Q91YK0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc49Q91YK0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc49Q91YK0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc49Q91YK0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc49Q91YK0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc49Q91YK0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc49Q91YK0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc49Q91YK0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc49Q91YK0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc49Q91YK0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc49Q91YK0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc49Q91YK0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc49Q91YK0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc49Q91YK0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc49Q91YK0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc49Q91YK0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc49Q91YK0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc49Q91YK0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc49Q91YK0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc49Q91YK0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc49Q91YK0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc49Q91YK0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc49Q91YK0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc49Q91YK0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc49Q91YK0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc49Q91YK0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc49Q91YK0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc49Q91YK0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc49Q91YK0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc49Q91YK0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc49Q91YK0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc49Q91YK0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc49Q91YK0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc49Q91YK0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc49Q91YK0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc49Q91YK0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc49Q91YK0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc49Q91YK0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc49Q91YK0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc49Q91YK0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc49Q91YK0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc49Q91YK0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc49Q91YK0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc49Q91YK0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc49Q91YK0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc49Q91YK0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc49Q91YK0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc49Q91YK0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc49Q91YK0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc49Q91YK0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc49Q91YK0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc49Q91YK0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc49Q91YK0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc49Q91YK0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc49Q91YK0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc49Q91YK0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc49Q91YK0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc49Q91YK0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc49Q91YK0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc49Q91YK0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc49Q91YK0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc49Q91YK0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc49Q91YK0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc49Q91YK0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc49Q91YK0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc49Q91YK0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc49Q91YK0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc49Q91YK0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc49Q91YK0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc49Q91YK0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc49Q91YK0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc49Q91YK0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc49Q91YK0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms