Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y20

Pcdha10, Protocadherin alpha-10, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha10Q91Y20 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcdha10Q91Y20 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pcdha10Q91Y20 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdha10Q91Y20 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcdha10Q91Y20 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcdha10Q91Y20 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdha10Q91Y20 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdha10Q91Y20 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcdha10Q91Y20 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcdha10Q91Y20 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcdha10Q91Y20 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcdha10Q91Y20 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcdha10Q91Y20 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcdha10Q91Y20 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdha10Q91Y20 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdha10Q91Y20 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdha10Q91Y20 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcdha10Q91Y20 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcdha10Q91Y20 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcdha10Q91Y20 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcdha10Q91Y20 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcdha10Q91Y20 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcdha10Q91Y20 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcdha10Q91Y20 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcdha10Q91Y20 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcdha10Q91Y20 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcdha10Q91Y20 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcdha10Q91Y20 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcdha10Q91Y20 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcdha10Q91Y20 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcdha10Q91Y20 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcdha10Q91Y20 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcdha10Q91Y20 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcdha10Q91Y20 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pcdha10Q91Y20 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pcdha10Q91Y20 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcdha10Q91Y20 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcdha10Q91Y20 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcdha10Q91Y20 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcdha10Q91Y20 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcdha10Q91Y20 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcdha10Q91Y20 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcdha10Q91Y20 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcdha10Q91Y20 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcdha10Q91Y20 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcdha10Q91Y20 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcdha10Q91Y20 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcdha10Q91Y20 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcdha10Q91Y20 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcdha10Q91Y20 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcdha10Q91Y20 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcdha10Q91Y20 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdha10Q91Y20 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdha10Q91Y20 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdha10Q91Y20 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdha10Q91Y20 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdha10Q91Y20 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdha10Q91Y20 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdha10Q91Y20 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdha10Q91Y20 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdha10Q91Y20 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdha10Q91Y20 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdha10Q91Y20 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdha10Q91Y20 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdha10Q91Y20 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdha10Q91Y20 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdha10Q91Y20 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdha10Q91Y20 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdha10Q91Y20 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcdha10Q91Y20 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdha10Q91Y20 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdha10Q91Y20 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdha10Q91Y20 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdha10Q91Y20 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdha10Q91Y20 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdha10Q91Y20 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdha10Q91Y20 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdha10Q91Y20 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdha10Q91Y20 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdha10Q91Y20 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdha10Q91Y20 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdha10Q91Y20 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdha10Q91Y20 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdha10Q91Y20 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdha10Q91Y20 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdha10Q91Y20 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdha10Q91Y20 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdha10Q91Y20 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdha10Q91Y20 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdha10Q91Y20 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdha10Q91Y20 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdha10Q91Y20 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdha10Q91Y20 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdha10Q91Y20 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdha10Q91Y20 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdha10Q91Y20 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdha10Q91Y20 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdha10Q91Y20 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha10Q91Y20 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha10Q91Y20 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms