Protein–RNA interactions for Protein: Q91X93

Prb1, Proline-rich protein BstNI subfamily 1, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prb1Q91X93 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prb1Q91X93 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prb1Q91X93 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prb1Q91X93 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prb1Q91X93 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prb1Q91X93 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prb1Q91X93 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prb1Q91X93 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prb1Q91X93 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Prb1Q91X93 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prb1Q91X93 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prb1Q91X93 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prb1Q91X93 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prb1Q91X93 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prb1Q91X93 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prb1Q91X93 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prb1Q91X93 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prb1Q91X93 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prb1Q91X93 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prb1Q91X93 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prb1Q91X93 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Prb1Q91X93 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prb1Q91X93 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Prb1Q91X93 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prb1Q91X93 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prb1Q91X93 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prb1Q91X93 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prb1Q91X93 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prb1Q91X93 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prb1Q91X93 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prb1Q91X93 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prb1Q91X93 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prb1Q91X93 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prb1Q91X93 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prb1Q91X93 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prb1Q91X93 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prb1Q91X93 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Prb1Q91X93 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prb1Q91X93 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Prb1Q91X93 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Prb1Q91X93 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prb1Q91X93 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prb1Q91X93 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prb1Q91X93 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prb1Q91X93 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prb1Q91X93 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Prb1Q91X93 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Prb1Q91X93 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prb1Q91X93 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prb1Q91X93 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prb1Q91X93 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prb1Q91X93 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prb1Q91X93 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Prb1Q91X93 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prb1Q91X93 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prb1Q91X93 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prb1Q91X93 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Prb1Q91X93 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prb1Q91X93 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prb1Q91X93 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prb1Q91X93 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prb1Q91X93 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prb1Q91X93 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prb1Q91X93 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prb1Q91X93 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prb1Q91X93 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prb1Q91X93 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prb1Q91X93 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prb1Q91X93 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prb1Q91X93 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Prb1Q91X93 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prb1Q91X93 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prb1Q91X93 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prb1Q91X93 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prb1Q91X93 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prb1Q91X93 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Prb1Q91X93 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prb1Q91X93 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prb1Q91X93 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prb1Q91X93 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prb1Q91X93 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prb1Q91X93 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prb1Q91X93 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prb1Q91X93 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prb1Q91X93 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prb1Q91X93 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prb1Q91X93 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prb1Q91X93 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prb1Q91X93 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prb1Q91X93 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prb1Q91X93 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prb1Q91X93 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prb1Q91X93 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prb1Q91X93 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prb1Q91X93 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prb1Q91X93 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prb1Q91X93 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Prb1Q91X93 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prb1Q91X93 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Prb1Q91X93 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms