Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx11Q91WL6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx11Q91WL6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx11Q91WL6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx11Q91WL6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snx11Q91WL6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx11Q91WL6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx11Q91WL6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx11Q91WL6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx11Q91WL6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx11Q91WL6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx11Q91WL6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx11Q91WL6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx11Q91WL6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx11Q91WL6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx11Q91WL6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx11Q91WL6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx11Q91WL6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx11Q91WL6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx11Q91WL6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx11Q91WL6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx11Q91WL6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx11Q91WL6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snx11Q91WL6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx11Q91WL6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx11Q91WL6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx11Q91WL6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx11Q91WL6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx11Q91WL6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx11Q91WL6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx11Q91WL6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx11Q91WL6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx11Q91WL6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx11Q91WL6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx11Q91WL6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx11Q91WL6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx11Q91WL6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx11Q91WL6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx11Q91WL6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx11Q91WL6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx11Q91WL6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx11Q91WL6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx11Q91WL6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx11Q91WL6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Snx11Q91WL6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx11Q91WL6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx11Q91WL6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx11Q91WL6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx11Q91WL6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx11Q91WL6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx11Q91WL6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx11Q91WL6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx11Q91WL6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx11Q91WL6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx11Q91WL6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx11Q91WL6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx11Q91WL6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx11Q91WL6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx11Q91WL6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx11Q91WL6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx11Q91WL6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx11Q91WL6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx11Q91WL6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx11Q91WL6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx11Q91WL6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx11Q91WL6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx11Q91WL6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx11Q91WL6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx11Q91WL6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx11Q91WL6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx11Q91WL6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx11Q91WL6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx11Q91WL6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx11Q91WL6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx11Q91WL6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx11Q91WL6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx11Q91WL6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx11Q91WL6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx11Q91WL6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx11Q91WL6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx11Q91WL6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx11Q91WL6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx11Q91WL6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx11Q91WL6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx11Q91WL6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx11Q91WL6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx11Q91WL6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx11Q91WL6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx11Q91WL6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx11Q91WL6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx11Q91WL6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx11Q91WL6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx11Q91WL6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx11Q91WL6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx11Q91WL6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx11Q91WL6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx11Q91WL6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx11Q91WL6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx11Q91WL6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx11Q91WL6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms