Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp3Q91W36 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp3Q91W36 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp3Q91W36 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp3Q91W36 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp3Q91W36 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp3Q91W36 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp3Q91W36 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp3Q91W36 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp3Q91W36 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp3Q91W36 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp3Q91W36 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp3Q91W36 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp3Q91W36 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp3Q91W36 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp3Q91W36 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp3Q91W36 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp3Q91W36 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp3Q91W36 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp3Q91W36 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp3Q91W36 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp3Q91W36 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp3Q91W36 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp3Q91W36 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp3Q91W36 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp3Q91W36 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp3Q91W36 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp3Q91W36 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp3Q91W36 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp3Q91W36 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp3Q91W36 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp3Q91W36 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp3Q91W36 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp3Q91W36 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp3Q91W36 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp3Q91W36 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Usp3Q91W36 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp3Q91W36 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp3Q91W36 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp3Q91W36 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp3Q91W36 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp3Q91W36 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp3Q91W36 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp3Q91W36 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp3Q91W36 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp3Q91W36 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp3Q91W36 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp3Q91W36 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp3Q91W36 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp3Q91W36 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp3Q91W36 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp3Q91W36 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp3Q91W36 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp3Q91W36 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp3Q91W36 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp3Q91W36 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp3Q91W36 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp3Q91W36 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp3Q91W36 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp3Q91W36 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp3Q91W36 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp3Q91W36 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp3Q91W36 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp3Q91W36 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp3Q91W36 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp3Q91W36 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp3Q91W36 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp3Q91W36 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp3Q91W36 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp3Q91W36 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp3Q91W36 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp3Q91W36 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp3Q91W36 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp3Q91W36 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp3Q91W36 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp3Q91W36 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp3Q91W36 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp3Q91W36 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp3Q91W36 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp3Q91W36 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp3Q91W36 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp3Q91W36 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp3Q91W36 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp3Q91W36 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp3Q91W36 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp3Q91W36 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp3Q91W36 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp3Q91W36 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp3Q91W36 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp3Q91W36 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp3Q91W36 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp3Q91W36 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp3Q91W36 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp3Q91W36 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp3Q91W36 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp3Q91W36 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp3Q91W36 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp3Q91W36 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp3Q91W36 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp3Q91W36 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.5 ms