Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF6

Col26a1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col26a1Q91VF6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Col26a1Q91VF6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Col26a1Q91VF6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Col26a1Q91VF6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Col26a1Q91VF6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Col26a1Q91VF6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,14■■□□□ 1,94
Col26a1Q91VF6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27,14■■□□□ 1,93
Col26a1Q91VF6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Col26a1Q91VF6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Col26a1Q91VF6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Col26a1Q91VF6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Col26a1Q91VF6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Col26a1Q91VF6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27,09■■□□□ 1,93
Col26a1Q91VF6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Col26a1Q91VF6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Col26a1Q91VF6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Col26a1Q91VF6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Col26a1Q91VF6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27,08■■□□□ 1,93
Col26a1Q91VF6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Col26a1Q91VF6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Col26a1Q91VF6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Col26a1Q91VF6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Col26a1Q91VF6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Col26a1Q91VF6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27,05■■□□□ 1,92
Col26a1Q91VF6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Col26a1Q91VF6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Col26a1Q91VF6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Col26a1Q91VF6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Col26a1Q91VF6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Col26a1Q91VF6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Col26a1Q91VF6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Col26a1Q91VF6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Col26a1Q91VF6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Col26a1Q91VF6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Col26a1Q91VF6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Col26a1Q91VF6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Col26a1Q91VF6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Col26a1Q91VF6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Col26a1Q91VF6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26,98■■□□□ 1,91
Col26a1Q91VF6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Col26a1Q91VF6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Col26a1Q91VF6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Col26a1Q91VF6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Col26a1Q91VF6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Col26a1Q91VF6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Col26a1Q91VF6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Col26a1Q91VF6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Col26a1Q91VF6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Col26a1Q91VF6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26,95■■□□□ 1,9
Col26a1Q91VF6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Col26a1Q91VF6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Col26a1Q91VF6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Col26a1Q91VF6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26,93■■□□□ 1,9
Col26a1Q91VF6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Col26a1Q91VF6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Col26a1Q91VF6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Col26a1Q91VF6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Col26a1Q91VF6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Col26a1Q91VF6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Col26a1Q91VF6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Col26a1Q91VF6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26,88■■□□□ 1,89
Col26a1Q91VF6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Col26a1Q91VF6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26,88■■□□□ 1,89
Col26a1Q91VF6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Col26a1Q91VF6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Col26a1Q91VF6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Col26a1Q91VF6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Col26a1Q91VF6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Col26a1Q91VF6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Col26a1Q91VF6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Col26a1Q91VF6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Col26a1Q91VF6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Col26a1Q91VF6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Col26a1Q91VF6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Col26a1Q91VF6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Col26a1Q91VF6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26,85■■□□□ 1,89
Col26a1Q91VF6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Col26a1Q91VF6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Col26a1Q91VF6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,83■■□□□ 1,89
Col26a1Q91VF6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Col26a1Q91VF6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Col26a1Q91VF6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Col26a1Q91VF6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Col26a1Q91VF6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Col26a1Q91VF6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Col26a1Q91VF6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Col26a1Q91VF6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Col26a1Q91VF6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Col26a1Q91VF6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Col26a1Q91VF6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Col26a1Q91VF6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Col26a1Q91VF6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Col26a1Q91VF6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Col26a1Q91VF6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Col26a1Q91VF6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Col26a1Q91VF6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26,76■■□□□ 1,87
Col26a1Q91VF6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Col26a1Q91VF6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Col26a1Q91VF6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Col26a1Q91VF6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79,4 ms