Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW4

Cacng5, Voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng5Q8VHW4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacng5Q8VHW4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacng5Q8VHW4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacng5Q8VHW4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacng5Q8VHW4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacng5Q8VHW4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacng5Q8VHW4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacng5Q8VHW4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacng5Q8VHW4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacng5Q8VHW4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacng5Q8VHW4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacng5Q8VHW4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacng5Q8VHW4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacng5Q8VHW4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacng5Q8VHW4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacng5Q8VHW4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacng5Q8VHW4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacng5Q8VHW4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacng5Q8VHW4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacng5Q8VHW4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacng5Q8VHW4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacng5Q8VHW4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacng5Q8VHW4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacng5Q8VHW4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacng5Q8VHW4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacng5Q8VHW4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacng5Q8VHW4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacng5Q8VHW4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacng5Q8VHW4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacng5Q8VHW4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacng5Q8VHW4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacng5Q8VHW4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacng5Q8VHW4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacng5Q8VHW4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacng5Q8VHW4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacng5Q8VHW4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacng5Q8VHW4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacng5Q8VHW4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacng5Q8VHW4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacng5Q8VHW4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacng5Q8VHW4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacng5Q8VHW4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cacng5Q8VHW4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacng5Q8VHW4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacng5Q8VHW4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacng5Q8VHW4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacng5Q8VHW4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacng5Q8VHW4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacng5Q8VHW4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacng5Q8VHW4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacng5Q8VHW4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacng5Q8VHW4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacng5Q8VHW4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacng5Q8VHW4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacng5Q8VHW4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacng5Q8VHW4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacng5Q8VHW4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacng5Q8VHW4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacng5Q8VHW4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacng5Q8VHW4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacng5Q8VHW4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacng5Q8VHW4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacng5Q8VHW4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacng5Q8VHW4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacng5Q8VHW4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacng5Q8VHW4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacng5Q8VHW4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacng5Q8VHW4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacng5Q8VHW4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacng5Q8VHW4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacng5Q8VHW4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacng5Q8VHW4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacng5Q8VHW4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacng5Q8VHW4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacng5Q8VHW4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacng5Q8VHW4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacng5Q8VHW4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacng5Q8VHW4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacng5Q8VHW4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacng5Q8VHW4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacng5Q8VHW4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacng5Q8VHW4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacng5Q8VHW4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacng5Q8VHW4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacng5Q8VHW4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacng5Q8VHW4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacng5Q8VHW4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacng5Q8VHW4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacng5Q8VHW4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacng5Q8VHW4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacng5Q8VHW4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacng5Q8VHW4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacng5Q8VHW4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacng5Q8VHW4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacng5Q8VHW4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacng5Q8VHW4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacng5Q8VHW4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacng5Q8VHW4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacng5Q8VHW4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacng5Q8VHW4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms