Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Uhrf1Q8VDF2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Uhrf1Q8VDF2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uhrf1Q8VDF2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uhrf1Q8VDF2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Uhrf1Q8VDF2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uhrf1Q8VDF2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uhrf1Q8VDF2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uhrf1Q8VDF2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uhrf1Q8VDF2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uhrf1Q8VDF2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uhrf1Q8VDF2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uhrf1Q8VDF2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uhrf1Q8VDF2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uhrf1Q8VDF2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uhrf1Q8VDF2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uhrf1Q8VDF2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uhrf1Q8VDF2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Uhrf1Q8VDF2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uhrf1Q8VDF2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uhrf1Q8VDF2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uhrf1Q8VDF2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Uhrf1Q8VDF2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uhrf1Q8VDF2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uhrf1Q8VDF2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uhrf1Q8VDF2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uhrf1Q8VDF2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Uhrf1Q8VDF2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Uhrf1Q8VDF2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Uhrf1Q8VDF2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Uhrf1Q8VDF2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Uhrf1Q8VDF2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Uhrf1Q8VDF2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Uhrf1Q8VDF2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Uhrf1Q8VDF2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uhrf1Q8VDF2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uhrf1Q8VDF2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uhrf1Q8VDF2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Uhrf1Q8VDF2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Uhrf1Q8VDF2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Uhrf1Q8VDF2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Uhrf1Q8VDF2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Uhrf1Q8VDF2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Uhrf1Q8VDF2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Uhrf1Q8VDF2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Uhrf1Q8VDF2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Uhrf1Q8VDF2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uhrf1Q8VDF2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uhrf1Q8VDF2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uhrf1Q8VDF2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uhrf1Q8VDF2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uhrf1Q8VDF2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Uhrf1Q8VDF2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Uhrf1Q8VDF2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Uhrf1Q8VDF2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Uhrf1Q8VDF2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Uhrf1Q8VDF2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Uhrf1Q8VDF2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Uhrf1Q8VDF2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Uhrf1Q8VDF2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Uhrf1Q8VDF2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Uhrf1Q8VDF2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Uhrf1Q8VDF2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Uhrf1Q8VDF2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Uhrf1Q8VDF2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uhrf1Q8VDF2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uhrf1Q8VDF2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uhrf1Q8VDF2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uhrf1Q8VDF2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uhrf1Q8VDF2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uhrf1Q8VDF2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uhrf1Q8VDF2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uhrf1Q8VDF2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uhrf1Q8VDF2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uhrf1Q8VDF2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uhrf1Q8VDF2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uhrf1Q8VDF2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Uhrf1Q8VDF2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Uhrf1Q8VDF2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Uhrf1Q8VDF2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Uhrf1Q8VDF2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Uhrf1Q8VDF2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Uhrf1Q8VDF2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Uhrf1Q8VDF2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Uhrf1Q8VDF2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Uhrf1Q8VDF2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Uhrf1Q8VDF2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Uhrf1Q8VDF2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uhrf1Q8VDF2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Uhrf1Q8VDF2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Uhrf1Q8VDF2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Uhrf1Q8VDF2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Uhrf1Q8VDF2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Uhrf1Q8VDF2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Uhrf1Q8VDF2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Uhrf1Q8VDF2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Uhrf1Q8VDF2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Uhrf1Q8VDF2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Uhrf1Q8VDF2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Uhrf1Q8VDF2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
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