Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCA5

Tmprss4, Transmembrane protease serine 4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss4Q8VCA5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmprss4Q8VCA5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmprss4Q8VCA5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmprss4Q8VCA5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmprss4Q8VCA5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmprss4Q8VCA5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmprss4Q8VCA5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmprss4Q8VCA5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmprss4Q8VCA5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmprss4Q8VCA5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmprss4Q8VCA5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmprss4Q8VCA5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmprss4Q8VCA5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmprss4Q8VCA5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmprss4Q8VCA5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmprss4Q8VCA5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmprss4Q8VCA5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmprss4Q8VCA5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tmprss4Q8VCA5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmprss4Q8VCA5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmprss4Q8VCA5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmprss4Q8VCA5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmprss4Q8VCA5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmprss4Q8VCA5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmprss4Q8VCA5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmprss4Q8VCA5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmprss4Q8VCA5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmprss4Q8VCA5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmprss4Q8VCA5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmprss4Q8VCA5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmprss4Q8VCA5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmprss4Q8VCA5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmprss4Q8VCA5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmprss4Q8VCA5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmprss4Q8VCA5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmprss4Q8VCA5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmprss4Q8VCA5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmprss4Q8VCA5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmprss4Q8VCA5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmprss4Q8VCA5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmprss4Q8VCA5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmprss4Q8VCA5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmprss4Q8VCA5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmprss4Q8VCA5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmprss4Q8VCA5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmprss4Q8VCA5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmprss4Q8VCA5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmprss4Q8VCA5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmprss4Q8VCA5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmprss4Q8VCA5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmprss4Q8VCA5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmprss4Q8VCA5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmprss4Q8VCA5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmprss4Q8VCA5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmprss4Q8VCA5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmprss4Q8VCA5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmprss4Q8VCA5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmprss4Q8VCA5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmprss4Q8VCA5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmprss4Q8VCA5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmprss4Q8VCA5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmprss4Q8VCA5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmprss4Q8VCA5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmprss4Q8VCA5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmprss4Q8VCA5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmprss4Q8VCA5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmprss4Q8VCA5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmprss4Q8VCA5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmprss4Q8VCA5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmprss4Q8VCA5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmprss4Q8VCA5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmprss4Q8VCA5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmprss4Q8VCA5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmprss4Q8VCA5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmprss4Q8VCA5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmprss4Q8VCA5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmprss4Q8VCA5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmprss4Q8VCA5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmprss4Q8VCA5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmprss4Q8VCA5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmprss4Q8VCA5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmprss4Q8VCA5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmprss4Q8VCA5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmprss4Q8VCA5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmprss4Q8VCA5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmprss4Q8VCA5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmprss4Q8VCA5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmprss4Q8VCA5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmprss4Q8VCA5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmprss4Q8VCA5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmprss4Q8VCA5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmprss4Q8VCA5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmprss4Q8VCA5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmprss4Q8VCA5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmprss4Q8VCA5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmprss4Q8VCA5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmprss4Q8VCA5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmprss4Q8VCA5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmprss4Q8VCA5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmprss4Q8VCA5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms