Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC33

Nxnl1, Nucleoredoxin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxnl1Q8VC33 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nxnl1Q8VC33 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nxnl1Q8VC33 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Nxnl1Q8VC33 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Nxnl1Q8VC33 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nxnl1Q8VC33 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nxnl1Q8VC33 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nxnl1Q8VC33 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nxnl1Q8VC33 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nxnl1Q8VC33 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nxnl1Q8VC33 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Nxnl1Q8VC33 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nxnl1Q8VC33 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nxnl1Q8VC33 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nxnl1Q8VC33 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nxnl1Q8VC33 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nxnl1Q8VC33 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nxnl1Q8VC33 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Nxnl1Q8VC33 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nxnl1Q8VC33 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nxnl1Q8VC33 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nxnl1Q8VC33 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nxnl1Q8VC33 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nxnl1Q8VC33 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nxnl1Q8VC33 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nxnl1Q8VC33 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nxnl1Q8VC33 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nxnl1Q8VC33 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nxnl1Q8VC33 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nxnl1Q8VC33 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nxnl1Q8VC33 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nxnl1Q8VC33 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nxnl1Q8VC33 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nxnl1Q8VC33 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nxnl1Q8VC33 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nxnl1Q8VC33 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nxnl1Q8VC33 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Nxnl1Q8VC33 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nxnl1Q8VC33 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nxnl1Q8VC33 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nxnl1Q8VC33 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nxnl1Q8VC33 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nxnl1Q8VC33 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nxnl1Q8VC33 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nxnl1Q8VC33 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nxnl1Q8VC33 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nxnl1Q8VC33 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nxnl1Q8VC33 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nxnl1Q8VC33 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nxnl1Q8VC33 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nxnl1Q8VC33 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nxnl1Q8VC33 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nxnl1Q8VC33 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nxnl1Q8VC33 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nxnl1Q8VC33 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nxnl1Q8VC33 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nxnl1Q8VC33 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nxnl1Q8VC33 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nxnl1Q8VC33 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nxnl1Q8VC33 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nxnl1Q8VC33 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nxnl1Q8VC33 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nxnl1Q8VC33 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nxnl1Q8VC33 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nxnl1Q8VC33 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nxnl1Q8VC33 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nxnl1Q8VC33 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nxnl1Q8VC33 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nxnl1Q8VC33 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nxnl1Q8VC33 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nxnl1Q8VC33 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nxnl1Q8VC33 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nxnl1Q8VC33 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nxnl1Q8VC33 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nxnl1Q8VC33 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nxnl1Q8VC33 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nxnl1Q8VC33 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nxnl1Q8VC33 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nxnl1Q8VC33 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nxnl1Q8VC33 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nxnl1Q8VC33 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Nxnl1Q8VC33 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nxnl1Q8VC33 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nxnl1Q8VC33 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nxnl1Q8VC33 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nxnl1Q8VC33 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nxnl1Q8VC33 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nxnl1Q8VC33 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nxnl1Q8VC33 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nxnl1Q8VC33 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Nxnl1Q8VC33 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nxnl1Q8VC33 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nxnl1Q8VC33 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Nxnl1Q8VC33 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nxnl1Q8VC33 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nxnl1Q8VC33 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nxnl1Q8VC33 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nxnl1Q8VC33 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nxnl1Q8VC33 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nxnl1Q8VC33 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178.6 ms