Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W7

Agr3, Anterior gradient protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Agr3Q8R3W7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Agr3Q8R3W7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Agr3Q8R3W7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Agr3Q8R3W7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Agr3Q8R3W7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Agr3Q8R3W7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Agr3Q8R3W7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Agr3Q8R3W7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Agr3Q8R3W7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Agr3Q8R3W7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Agr3Q8R3W7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Agr3Q8R3W7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Agr3Q8R3W7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Agr3Q8R3W7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Agr3Q8R3W7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Agr3Q8R3W7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Agr3Q8R3W7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Agr3Q8R3W7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Agr3Q8R3W7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Agr3Q8R3W7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Agr3Q8R3W7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Agr3Q8R3W7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Agr3Q8R3W7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Agr3Q8R3W7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Agr3Q8R3W7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Agr3Q8R3W7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Agr3Q8R3W7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Agr3Q8R3W7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Agr3Q8R3W7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Agr3Q8R3W7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Agr3Q8R3W7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Agr3Q8R3W7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Agr3Q8R3W7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Agr3Q8R3W7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Agr3Q8R3W7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Agr3Q8R3W7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Agr3Q8R3W7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Agr3Q8R3W7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Agr3Q8R3W7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Agr3Q8R3W7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Agr3Q8R3W7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Agr3Q8R3W7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Agr3Q8R3W7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Agr3Q8R3W7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Agr3Q8R3W7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Agr3Q8R3W7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Agr3Q8R3W7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Agr3Q8R3W7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Agr3Q8R3W7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Agr3Q8R3W7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Agr3Q8R3W7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Agr3Q8R3W7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Agr3Q8R3W7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Agr3Q8R3W7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Agr3Q8R3W7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Agr3Q8R3W7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Agr3Q8R3W7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Agr3Q8R3W7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Agr3Q8R3W7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Agr3Q8R3W7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Agr3Q8R3W7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Agr3Q8R3W7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Agr3Q8R3W7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Agr3Q8R3W7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Agr3Q8R3W7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Agr3Q8R3W7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Agr3Q8R3W7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Agr3Q8R3W7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Agr3Q8R3W7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Agr3Q8R3W7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Agr3Q8R3W7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Agr3Q8R3W7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Agr3Q8R3W7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Agr3Q8R3W7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Agr3Q8R3W7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Agr3Q8R3W7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Agr3Q8R3W7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Agr3Q8R3W7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Agr3Q8R3W7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Agr3Q8R3W7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Agr3Q8R3W7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Agr3Q8R3W7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Agr3Q8R3W7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Agr3Q8R3W7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Agr3Q8R3W7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Agr3Q8R3W7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Agr3Q8R3W7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Agr3Q8R3W7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Agr3Q8R3W7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Agr3Q8R3W7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Agr3Q8R3W7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Agr3Q8R3W7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Agr3Q8R3W7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Agr3Q8R3W7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Agr3Q8R3W7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Agr3Q8R3W7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Agr3Q8R3W7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Agr3Q8R3W7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Agr3Q8R3W7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Agr3Q8R3W7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms