Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2G6

Ccdc80, Coiled-coil domain-containing protein 80, mousemouse

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc80Q8R2G6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc80Q8R2G6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc80Q8R2G6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc80Q8R2G6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc80Q8R2G6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc80Q8R2G6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc80Q8R2G6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc80Q8R2G6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc80Q8R2G6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc80Q8R2G6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc80Q8R2G6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc80Q8R2G6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc80Q8R2G6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc80Q8R2G6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc80Q8R2G6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc80Q8R2G6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc80Q8R2G6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc80Q8R2G6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc80Q8R2G6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc80Q8R2G6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc80Q8R2G6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc80Q8R2G6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc80Q8R2G6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc80Q8R2G6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc80Q8R2G6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc80Q8R2G6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc80Q8R2G6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc80Q8R2G6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc80Q8R2G6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc80Q8R2G6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc80Q8R2G6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc80Q8R2G6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc80Q8R2G6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc80Q8R2G6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc80Q8R2G6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc80Q8R2G6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc80Q8R2G6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc80Q8R2G6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc80Q8R2G6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc80Q8R2G6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc80Q8R2G6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc80Q8R2G6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc80Q8R2G6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc80Q8R2G6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc80Q8R2G6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc80Q8R2G6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc80Q8R2G6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc80Q8R2G6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc80Q8R2G6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc80Q8R2G6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc80Q8R2G6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc80Q8R2G6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc80Q8R2G6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc80Q8R2G6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc80Q8R2G6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc80Q8R2G6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc80Q8R2G6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc80Q8R2G6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc80Q8R2G6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc80Q8R2G6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc80Q8R2G6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc80Q8R2G6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc80Q8R2G6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc80Q8R2G6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc80Q8R2G6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc80Q8R2G6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc80Q8R2G6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc80Q8R2G6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc80Q8R2G6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc80Q8R2G6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc80Q8R2G6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc80Q8R2G6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc80Q8R2G6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc80Q8R2G6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc80Q8R2G6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc80Q8R2G6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc80Q8R2G6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc80Q8R2G6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc80Q8R2G6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc80Q8R2G6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc80Q8R2G6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc80Q8R2G6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc80Q8R2G6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc80Q8R2G6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc80Q8R2G6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc80Q8R2G6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc80Q8R2G6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc80Q8R2G6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc80Q8R2G6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc80Q8R2G6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc80Q8R2G6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc80Q8R2G6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc80Q8R2G6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc80Q8R2G6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc80Q8R2G6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc80Q8R2G6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc80Q8R2G6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc80Q8R2G6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc80Q8R2G6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc80Q8R2G6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms