Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1N4

Nudcd3, NudC domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd3Q8R1N4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nudcd3Q8R1N4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nudcd3Q8R1N4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nudcd3Q8R1N4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nudcd3Q8R1N4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nudcd3Q8R1N4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nudcd3Q8R1N4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nudcd3Q8R1N4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nudcd3Q8R1N4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nudcd3Q8R1N4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nudcd3Q8R1N4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nudcd3Q8R1N4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nudcd3Q8R1N4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nudcd3Q8R1N4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nudcd3Q8R1N4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nudcd3Q8R1N4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nudcd3Q8R1N4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nudcd3Q8R1N4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nudcd3Q8R1N4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nudcd3Q8R1N4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nudcd3Q8R1N4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nudcd3Q8R1N4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nudcd3Q8R1N4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nudcd3Q8R1N4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nudcd3Q8R1N4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nudcd3Q8R1N4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Nudcd3Q8R1N4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nudcd3Q8R1N4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nudcd3Q8R1N4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nudcd3Q8R1N4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nudcd3Q8R1N4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nudcd3Q8R1N4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nudcd3Q8R1N4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nudcd3Q8R1N4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nudcd3Q8R1N4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nudcd3Q8R1N4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nudcd3Q8R1N4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nudcd3Q8R1N4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nudcd3Q8R1N4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Nudcd3Q8R1N4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nudcd3Q8R1N4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nudcd3Q8R1N4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nudcd3Q8R1N4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nudcd3Q8R1N4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nudcd3Q8R1N4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nudcd3Q8R1N4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nudcd3Q8R1N4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nudcd3Q8R1N4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nudcd3Q8R1N4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nudcd3Q8R1N4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nudcd3Q8R1N4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nudcd3Q8R1N4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nudcd3Q8R1N4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nudcd3Q8R1N4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nudcd3Q8R1N4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nudcd3Q8R1N4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nudcd3Q8R1N4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nudcd3Q8R1N4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nudcd3Q8R1N4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nudcd3Q8R1N4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nudcd3Q8R1N4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nudcd3Q8R1N4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nudcd3Q8R1N4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nudcd3Q8R1N4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nudcd3Q8R1N4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nudcd3Q8R1N4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nudcd3Q8R1N4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nudcd3Q8R1N4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nudcd3Q8R1N4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nudcd3Q8R1N4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nudcd3Q8R1N4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nudcd3Q8R1N4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nudcd3Q8R1N4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nudcd3Q8R1N4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nudcd3Q8R1N4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nudcd3Q8R1N4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nudcd3Q8R1N4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nudcd3Q8R1N4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nudcd3Q8R1N4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nudcd3Q8R1N4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nudcd3Q8R1N4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nudcd3Q8R1N4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nudcd3Q8R1N4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nudcd3Q8R1N4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nudcd3Q8R1N4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nudcd3Q8R1N4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nudcd3Q8R1N4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nudcd3Q8R1N4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nudcd3Q8R1N4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nudcd3Q8R1N4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nudcd3Q8R1N4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nudcd3Q8R1N4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nudcd3Q8R1N4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nudcd3Q8R1N4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nudcd3Q8R1N4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nudcd3Q8R1N4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nudcd3Q8R1N4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nudcd3Q8R1N4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nudcd3Q8R1N4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nudcd3Q8R1N4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms