Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Treml1Q8K558 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Treml1Q8K558 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Treml1Q8K558 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Treml1Q8K558 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Treml1Q8K558 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Treml1Q8K558 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Treml1Q8K558 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Treml1Q8K558 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Treml1Q8K558 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Treml1Q8K558 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Treml1Q8K558 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Treml1Q8K558 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Treml1Q8K558 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Treml1Q8K558 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Treml1Q8K558 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Treml1Q8K558 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Treml1Q8K558 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Treml1Q8K558 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Treml1Q8K558 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Treml1Q8K558 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Treml1Q8K558 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Treml1Q8K558 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Treml1Q8K558 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Treml1Q8K558 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Treml1Q8K558 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Treml1Q8K558 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Treml1Q8K558 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Treml1Q8K558 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Treml1Q8K558 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Treml1Q8K558 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Treml1Q8K558 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Treml1Q8K558 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Treml1Q8K558 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Treml1Q8K558 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Treml1Q8K558 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Treml1Q8K558 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Treml1Q8K558 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Treml1Q8K558 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Treml1Q8K558 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Treml1Q8K558 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Treml1Q8K558 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Treml1Q8K558 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Treml1Q8K558 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Treml1Q8K558 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Treml1Q8K558 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Treml1Q8K558 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Treml1Q8K558 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Treml1Q8K558 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Treml1Q8K558 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Treml1Q8K558 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Treml1Q8K558 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Treml1Q8K558 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Treml1Q8K558 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Treml1Q8K558 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Treml1Q8K558 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Treml1Q8K558 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Treml1Q8K558 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Treml1Q8K558 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Treml1Q8K558 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Treml1Q8K558 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Treml1Q8K558 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Treml1Q8K558 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Treml1Q8K558 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Treml1Q8K558 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Treml1Q8K558 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Treml1Q8K558 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Treml1Q8K558 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Treml1Q8K558 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Treml1Q8K558 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Treml1Q8K558 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Treml1Q8K558 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Treml1Q8K558 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Treml1Q8K558 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Treml1Q8K558 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Treml1Q8K558 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Treml1Q8K558 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Treml1Q8K558 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Treml1Q8K558 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Treml1Q8K558 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Treml1Q8K558 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Treml1Q8K558 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Treml1Q8K558 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Treml1Q8K558 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Treml1Q8K558 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Treml1Q8K558 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Treml1Q8K558 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Treml1Q8K558 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Treml1Q8K558 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Treml1Q8K558 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Treml1Q8K558 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Treml1Q8K558 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Treml1Q8K558 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Treml1Q8K558 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Treml1Q8K558 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Treml1Q8K558 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Treml1Q8K558 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Treml1Q8K558 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Treml1Q8K558 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Treml1Q8K558 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms