Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pitrm1Q8K411 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pitrm1Q8K411 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pitrm1Q8K411 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pitrm1Q8K411 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pitrm1Q8K411 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pitrm1Q8K411 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Pitrm1Q8K411 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pitrm1Q8K411 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pitrm1Q8K411 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pitrm1Q8K411 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Pitrm1Q8K411 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pitrm1Q8K411 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pitrm1Q8K411 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pitrm1Q8K411 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pitrm1Q8K411 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pitrm1Q8K411 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pitrm1Q8K411 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Pitrm1Q8K411 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pitrm1Q8K411 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pitrm1Q8K411 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pitrm1Q8K411 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pitrm1Q8K411 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pitrm1Q8K411 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pitrm1Q8K411 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pitrm1Q8K411 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pitrm1Q8K411 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pitrm1Q8K411 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pitrm1Q8K411 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Pitrm1Q8K411 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pitrm1Q8K411 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pitrm1Q8K411 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pitrm1Q8K411 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pitrm1Q8K411 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pitrm1Q8K411 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pitrm1Q8K411 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pitrm1Q8K411 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pitrm1Q8K411 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pitrm1Q8K411 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pitrm1Q8K411 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pitrm1Q8K411 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pitrm1Q8K411 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pitrm1Q8K411 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pitrm1Q8K411 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pitrm1Q8K411 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pitrm1Q8K411 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pitrm1Q8K411 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pitrm1Q8K411 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pitrm1Q8K411 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pitrm1Q8K411 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pitrm1Q8K411 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pitrm1Q8K411 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pitrm1Q8K411 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pitrm1Q8K411 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pitrm1Q8K411 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pitrm1Q8K411 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pitrm1Q8K411 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pitrm1Q8K411 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pitrm1Q8K411 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pitrm1Q8K411 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pitrm1Q8K411 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pitrm1Q8K411 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pitrm1Q8K411 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pitrm1Q8K411 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pitrm1Q8K411 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pitrm1Q8K411 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pitrm1Q8K411 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pitrm1Q8K411 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pitrm1Q8K411 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pitrm1Q8K411 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pitrm1Q8K411 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pitrm1Q8K411 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pitrm1Q8K411 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pitrm1Q8K411 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pitrm1Q8K411 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pitrm1Q8K411 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pitrm1Q8K411 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pitrm1Q8K411 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pitrm1Q8K411 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pitrm1Q8K411 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pitrm1Q8K411 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pitrm1Q8K411 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms