Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z8

Ube2q2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q2, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q2Q8K2Z8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ube2q2Q8K2Z8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ube2q2Q8K2Z8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ube2q2Q8K2Z8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ube2q2Q8K2Z8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ube2q2Q8K2Z8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ube2q2Q8K2Z8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ube2q2Q8K2Z8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ube2q2Q8K2Z8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ube2q2Q8K2Z8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ube2q2Q8K2Z8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ube2q2Q8K2Z8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ube2q2Q8K2Z8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ube2q2Q8K2Z8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ube2q2Q8K2Z8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ube2q2Q8K2Z8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ube2q2Q8K2Z8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ube2q2Q8K2Z8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ube2q2Q8K2Z8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube2q2Q8K2Z8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube2q2Q8K2Z8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube2q2Q8K2Z8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube2q2Q8K2Z8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube2q2Q8K2Z8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube2q2Q8K2Z8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ube2q2Q8K2Z8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ube2q2Q8K2Z8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube2q2Q8K2Z8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube2q2Q8K2Z8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube2q2Q8K2Z8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube2q2Q8K2Z8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube2q2Q8K2Z8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ube2q2Q8K2Z8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ube2q2Q8K2Z8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ube2q2Q8K2Z8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ube2q2Q8K2Z8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ube2q2Q8K2Z8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ube2q2Q8K2Z8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ube2q2Q8K2Z8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ube2q2Q8K2Z8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ube2q2Q8K2Z8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ube2q2Q8K2Z8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ube2q2Q8K2Z8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ube2q2Q8K2Z8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ube2q2Q8K2Z8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ube2q2Q8K2Z8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ube2q2Q8K2Z8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ube2q2Q8K2Z8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ube2q2Q8K2Z8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ube2q2Q8K2Z8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ube2q2Q8K2Z8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ube2q2Q8K2Z8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ube2q2Q8K2Z8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ube2q2Q8K2Z8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ube2q2Q8K2Z8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ube2q2Q8K2Z8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ube2q2Q8K2Z8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ube2q2Q8K2Z8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube2q2Q8K2Z8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube2q2Q8K2Z8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube2q2Q8K2Z8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube2q2Q8K2Z8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube2q2Q8K2Z8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube2q2Q8K2Z8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube2q2Q8K2Z8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube2q2Q8K2Z8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ube2q2Q8K2Z8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ube2q2Q8K2Z8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ube2q2Q8K2Z8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ube2q2Q8K2Z8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ube2q2Q8K2Z8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ube2q2Q8K2Z8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube2q2Q8K2Z8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube2q2Q8K2Z8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube2q2Q8K2Z8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube2q2Q8K2Z8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube2q2Q8K2Z8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube2q2Q8K2Z8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube2q2Q8K2Z8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube2q2Q8K2Z8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ube2q2Q8K2Z8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ube2q2Q8K2Z8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ube2q2Q8K2Z8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ube2q2Q8K2Z8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ube2q2Q8K2Z8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ube2q2Q8K2Z8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ube2q2Q8K2Z8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ube2q2Q8K2Z8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ube2q2Q8K2Z8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ube2q2Q8K2Z8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ube2q2Q8K2Z8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ube2q2Q8K2Z8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube2q2Q8K2Z8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube2q2Q8K2Z8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube2q2Q8K2Z8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ube2q2Q8K2Z8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ube2q2Q8K2Z8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ube2q2Q8K2Z8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube2q2Q8K2Z8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube2q2Q8K2Z8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms