Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hacd3Q8K2C9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hacd3Q8K2C9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hacd3Q8K2C9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hacd3Q8K2C9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hacd3Q8K2C9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hacd3Q8K2C9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hacd3Q8K2C9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hacd3Q8K2C9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hacd3Q8K2C9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hacd3Q8K2C9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hacd3Q8K2C9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hacd3Q8K2C9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hacd3Q8K2C9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hacd3Q8K2C9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hacd3Q8K2C9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hacd3Q8K2C9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hacd3Q8K2C9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hacd3Q8K2C9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hacd3Q8K2C9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hacd3Q8K2C9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hacd3Q8K2C9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hacd3Q8K2C9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hacd3Q8K2C9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hacd3Q8K2C9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hacd3Q8K2C9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hacd3Q8K2C9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hacd3Q8K2C9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hacd3Q8K2C9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hacd3Q8K2C9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hacd3Q8K2C9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hacd3Q8K2C9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hacd3Q8K2C9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hacd3Q8K2C9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hacd3Q8K2C9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hacd3Q8K2C9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hacd3Q8K2C9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hacd3Q8K2C9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hacd3Q8K2C9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hacd3Q8K2C9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hacd3Q8K2C9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hacd3Q8K2C9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hacd3Q8K2C9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hacd3Q8K2C9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hacd3Q8K2C9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hacd3Q8K2C9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hacd3Q8K2C9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hacd3Q8K2C9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hacd3Q8K2C9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hacd3Q8K2C9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hacd3Q8K2C9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hacd3Q8K2C9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hacd3Q8K2C9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hacd3Q8K2C9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hacd3Q8K2C9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hacd3Q8K2C9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hacd3Q8K2C9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hacd3Q8K2C9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hacd3Q8K2C9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hacd3Q8K2C9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Hacd3Q8K2C9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hacd3Q8K2C9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hacd3Q8K2C9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hacd3Q8K2C9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hacd3Q8K2C9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hacd3Q8K2C9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hacd3Q8K2C9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hacd3Q8K2C9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hacd3Q8K2C9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hacd3Q8K2C9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hacd3Q8K2C9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hacd3Q8K2C9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hacd3Q8K2C9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hacd3Q8K2C9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hacd3Q8K2C9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hacd3Q8K2C9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hacd3Q8K2C9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hacd3Q8K2C9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hacd3Q8K2C9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hacd3Q8K2C9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hacd3Q8K2C9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hacd3Q8K2C9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hacd3Q8K2C9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hacd3Q8K2C9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hacd3Q8K2C9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hacd3Q8K2C9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hacd3Q8K2C9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hacd3Q8K2C9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hacd3Q8K2C9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hacd3Q8K2C9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hacd3Q8K2C9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hacd3Q8K2C9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hacd3Q8K2C9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hacd3Q8K2C9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hacd3Q8K2C9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hacd3Q8K2C9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hacd3Q8K2C9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hacd3Q8K2C9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hacd3Q8K2C9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hacd3Q8K2C9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms