Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZX6

Clec4a3, C-type lectin domain family 4, member a3, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4a3Q8JZX6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clec4a3Q8JZX6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clec4a3Q8JZX6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clec4a3Q8JZX6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clec4a3Q8JZX6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clec4a3Q8JZX6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clec4a3Q8JZX6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clec4a3Q8JZX6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clec4a3Q8JZX6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clec4a3Q8JZX6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clec4a3Q8JZX6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Clec4a3Q8JZX6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clec4a3Q8JZX6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Clec4a3Q8JZX6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clec4a3Q8JZX6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clec4a3Q8JZX6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clec4a3Q8JZX6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clec4a3Q8JZX6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clec4a3Q8JZX6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clec4a3Q8JZX6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clec4a3Q8JZX6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clec4a3Q8JZX6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clec4a3Q8JZX6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clec4a3Q8JZX6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clec4a3Q8JZX6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Clec4a3Q8JZX6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clec4a3Q8JZX6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clec4a3Q8JZX6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clec4a3Q8JZX6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clec4a3Q8JZX6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Clec4a3Q8JZX6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clec4a3Q8JZX6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clec4a3Q8JZX6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clec4a3Q8JZX6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clec4a3Q8JZX6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clec4a3Q8JZX6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clec4a3Q8JZX6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Clec4a3Q8JZX6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clec4a3Q8JZX6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clec4a3Q8JZX6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clec4a3Q8JZX6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clec4a3Q8JZX6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Clec4a3Q8JZX6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clec4a3Q8JZX6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clec4a3Q8JZX6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clec4a3Q8JZX6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clec4a3Q8JZX6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clec4a3Q8JZX6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clec4a3Q8JZX6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clec4a3Q8JZX6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Clec4a3Q8JZX6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clec4a3Q8JZX6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clec4a3Q8JZX6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clec4a3Q8JZX6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clec4a3Q8JZX6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clec4a3Q8JZX6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clec4a3Q8JZX6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clec4a3Q8JZX6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clec4a3Q8JZX6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Clec4a3Q8JZX6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clec4a3Q8JZX6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clec4a3Q8JZX6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clec4a3Q8JZX6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clec4a3Q8JZX6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clec4a3Q8JZX6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clec4a3Q8JZX6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clec4a3Q8JZX6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Clec4a3Q8JZX6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clec4a3Q8JZX6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clec4a3Q8JZX6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clec4a3Q8JZX6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clec4a3Q8JZX6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clec4a3Q8JZX6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clec4a3Q8JZX6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clec4a3Q8JZX6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clec4a3Q8JZX6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clec4a3Q8JZX6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clec4a3Q8JZX6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clec4a3Q8JZX6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clec4a3Q8JZX6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clec4a3Q8JZX6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clec4a3Q8JZX6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clec4a3Q8JZX6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clec4a3Q8JZX6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clec4a3Q8JZX6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clec4a3Q8JZX6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clec4a3Q8JZX6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clec4a3Q8JZX6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clec4a3Q8JZX6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clec4a3Q8JZX6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clec4a3Q8JZX6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clec4a3Q8JZX6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clec4a3Q8JZX6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clec4a3Q8JZX6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clec4a3Q8JZX6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clec4a3Q8JZX6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clec4a3Q8JZX6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clec4a3Q8JZX6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Clec4a3Q8JZX6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Clec4a3Q8JZX6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms