Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE0

Serpina11, Serpin A11, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina11Q8CIE0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Serpina11Q8CIE0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Serpina11Q8CIE0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Serpina11Q8CIE0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Serpina11Q8CIE0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Serpina11Q8CIE0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Serpina11Q8CIE0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Serpina11Q8CIE0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Serpina11Q8CIE0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Serpina11Q8CIE0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Serpina11Q8CIE0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Serpina11Q8CIE0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Serpina11Q8CIE0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Serpina11Q8CIE0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Serpina11Q8CIE0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Serpina11Q8CIE0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Serpina11Q8CIE0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Serpina11Q8CIE0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Serpina11Q8CIE0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Serpina11Q8CIE0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Serpina11Q8CIE0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Serpina11Q8CIE0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Serpina11Q8CIE0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Serpina11Q8CIE0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Serpina11Q8CIE0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Serpina11Q8CIE0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Serpina11Q8CIE0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Serpina11Q8CIE0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Serpina11Q8CIE0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Serpina11Q8CIE0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Serpina11Q8CIE0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Serpina11Q8CIE0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Serpina11Q8CIE0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Serpina11Q8CIE0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Serpina11Q8CIE0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Serpina11Q8CIE0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Serpina11Q8CIE0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Serpina11Q8CIE0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Serpina11Q8CIE0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Serpina11Q8CIE0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Serpina11Q8CIE0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Serpina11Q8CIE0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Serpina11Q8CIE0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Serpina11Q8CIE0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Serpina11Q8CIE0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Serpina11Q8CIE0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Serpina11Q8CIE0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Serpina11Q8CIE0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Serpina11Q8CIE0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Serpina11Q8CIE0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Serpina11Q8CIE0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Serpina11Q8CIE0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Serpina11Q8CIE0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Serpina11Q8CIE0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Serpina11Q8CIE0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Serpina11Q8CIE0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Serpina11Q8CIE0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Serpina11Q8CIE0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Serpina11Q8CIE0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Serpina11Q8CIE0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Serpina11Q8CIE0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Serpina11Q8CIE0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Serpina11Q8CIE0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Serpina11Q8CIE0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Serpina11Q8CIE0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Serpina11Q8CIE0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Serpina11Q8CIE0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Serpina11Q8CIE0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Serpina11Q8CIE0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Serpina11Q8CIE0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Serpina11Q8CIE0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Serpina11Q8CIE0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Serpina11Q8CIE0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Serpina11Q8CIE0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Serpina11Q8CIE0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Serpina11Q8CIE0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Serpina11Q8CIE0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Serpina11Q8CIE0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Serpina11Q8CIE0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Serpina11Q8CIE0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Serpina11Q8CIE0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Serpina11Q8CIE0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Serpina11Q8CIE0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Serpina11Q8CIE0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Serpina11Q8CIE0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Serpina11Q8CIE0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Serpina11Q8CIE0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Serpina11Q8CIE0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Serpina11Q8CIE0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Serpina11Q8CIE0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Serpina11Q8CIE0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Serpina11Q8CIE0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Serpina11Q8CIE0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Serpina11Q8CIE0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Serpina11Q8CIE0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Serpina11Q8CIE0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Serpina11Q8CIE0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Serpina11Q8CIE0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Serpina11Q8CIE0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Serpina11Q8CIE0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms