Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH25

Sltm, SAFB-like transcription modulator, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SltmQ8CH25 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SltmQ8CH25 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SltmQ8CH25 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SltmQ8CH25 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SltmQ8CH25 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SltmQ8CH25 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SltmQ8CH25 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SltmQ8CH25 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SltmQ8CH25 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SltmQ8CH25 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SltmQ8CH25 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SltmQ8CH25 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SltmQ8CH25 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SltmQ8CH25 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SltmQ8CH25 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SltmQ8CH25 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SltmQ8CH25 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SltmQ8CH25 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SltmQ8CH25 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SltmQ8CH25 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SltmQ8CH25 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SltmQ8CH25 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SltmQ8CH25 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SltmQ8CH25 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SltmQ8CH25 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SltmQ8CH25 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SltmQ8CH25 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SltmQ8CH25 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SltmQ8CH25 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SltmQ8CH25 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SltmQ8CH25 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SltmQ8CH25 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SltmQ8CH25 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SltmQ8CH25 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SltmQ8CH25 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SltmQ8CH25 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SltmQ8CH25 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SltmQ8CH25 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SltmQ8CH25 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SltmQ8CH25 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SltmQ8CH25 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SltmQ8CH25 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SltmQ8CH25 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SltmQ8CH25 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SltmQ8CH25 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SltmQ8CH25 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SltmQ8CH25 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SltmQ8CH25 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SltmQ8CH25 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SltmQ8CH25 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SltmQ8CH25 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SltmQ8CH25 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SltmQ8CH25 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SltmQ8CH25 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SltmQ8CH25 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SltmQ8CH25 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SltmQ8CH25 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SltmQ8CH25 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SltmQ8CH25 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SltmQ8CH25 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SltmQ8CH25 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SltmQ8CH25 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SltmQ8CH25 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SltmQ8CH25 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SltmQ8CH25 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SltmQ8CH25 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SltmQ8CH25 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SltmQ8CH25 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SltmQ8CH25 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SltmQ8CH25 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SltmQ8CH25 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SltmQ8CH25 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SltmQ8CH25 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SltmQ8CH25 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SltmQ8CH25 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SltmQ8CH25 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SltmQ8CH25 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SltmQ8CH25 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SltmQ8CH25 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SltmQ8CH25 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SltmQ8CH25 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SltmQ8CH25 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SltmQ8CH25 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SltmQ8CH25 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SltmQ8CH25 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SltmQ8CH25 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SltmQ8CH25 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SltmQ8CH25 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SltmQ8CH25 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SltmQ8CH25 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SltmQ8CH25 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SltmQ8CH25 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SltmQ8CH25 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SltmQ8CH25 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SltmQ8CH25 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SltmQ8CH25 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SltmQ8CH25 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SltmQ8CH25 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SltmQ8CH25 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SltmQ8CH25 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms